Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN77010
GATCTCCATCTTTAATTATATTCAAACCAAAAGCCCAAAAGGCGAATTCAGAGTACCGTTTTCTTTCCATTTTTGCTTGTTGATTTCAATTGAA
TTGTGGTTGTTCCAACCATGGCCAAAAGCCCGATTGATCTTCCATACCAACAAACATGCTGCTAAAACATTCTTCTTTAATGGTACTCGACTGG
TCGAGTTTTTGGCAATGAAGTTGATGATCTGCTGGCCTTGATGATGAATTGTGGAAAAGTTGATGAGCCACAATGTTATTTGGGTTAGGCCTAT
CGATATTGGACGATGGAAAAAGATTAGGGATCGGTTGTTGATGGTGTTGGTGTTGATGGTGTGACGATAAGGGGCTATCGTTGGGTGGTGTTCT
TGAGATATCTAGCTTGATTTCAGAGCTGTTTTCACTTCTATTGCTGCTCGATCCTTCGGTTTCTTTAACGTTGAGGTTGATTAGTTCTGTTGGC
TCCCTATTTTTAAGTGCCATTATCTCAGCATGAAGTTTATGATTTTGAGATTGGAGGGAATCATTCTCAGCTTTAACAGCATCAAACTGTCTTT
TGAGAGCATCATAGTCTTTTTCCAACTGTTTAGTTTTCCATCTAGCTCTTCTGTTTTGAAACCATATAGCAATCTGTCTTGGTTGAAGTCCAAG
TGCTCTTGCAAGCTGCATTTTTCTTTCAGGTTCAAGCTTATTGCCCAACTCAAAATTCCTCTCAAGTGTCTTCACTTGTTCCATATTTAACCTC
CTCTTTTTCTCTCCTGCTAGCAACTGTGATCCATCATCTGATAATTCATCTTCACCATTCATGTTTCCTTCTTGATCACATCCATCTATGTTGT
TCATACCCGAATACGACATCGATCTTTTTCCCAAGAAAGAAGCCACACCACTAAAATCTTGAGTGGTGGTGCAAGGTTGGAGAATTGGAGAGAG
AGAAGTAGGGGCATGATGGTCATCTTCTTGGGAAGATTGTAACATAAAATTGTTGGAGAAGAAGGCCATTCCAGTGCAAGTCATGAGCTAATTA
ACTCTATATAGCTTTGATCATATGACTTGGGTCAACATTTCAATAAGTTTTTGTGGTCTCATCATCATGTTTGATAGAGATCTAGAAAGAGAGA
GAGAGAGAGAG
TGAGAGGAGGTGTGAAGAATATTATGGT

Primers for UN77010 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1GGGCATGATGGTCATCTTCT 59.89320ACCATAATATTCTTCACACCTCCT 57.23124219 9491167
2ATTGTTGGAGAAGAAGGCCA 59.6720ACCATAATATTCTTCACACCTCCT 57.23124179 9891167
3GCAAGGTTGGAGAATTGGAG 59.6720ACCATAATATTCTTCACACCTCCT 57.23124251 9171167