Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN76119
GGCAAAATAGTCATAAAGTACATAAAAAATACAATAAAATCAAATTTAGTATATAAAATAGCAGAAATAATTGTTCGATACATGGAAATTATGG
CAACTATGATACATTATCGTGCCATTAGCCAAAAAATATATATATATATATAACACAAATCTATTGTAAGACAATTCAAATCGATTTGTCAATC
AACTAAATACTTGCATATAGGAGCTGGTTCCATGTATCGGGTAGCCCTGGAACACACCAATGACTGCAGTCTACACCTGAGCCGCCACCATAAG
ACGAAGGATGTGCATCTTTCCTTAATTGTGACAAGGTTGTGATGTCTAGCAAGTGAACTGGGTTCTTTATATTTCCTAAAACTTTGTTCAAAAC
ACCTTGAGCTTCAGGTAATCCTGCTGGATATGTTGATCCTTGTAGTGGTTGTAGTTCTCCATAGCAAGTCTTGGATGATGATCCCCATTCTTTT
CCCAGATAATGCGAAGGAGAAATCCCTTGAAAGAATACTTTGGTCTTGGACGGATTAACATTTTGATCGACCCATTTCCCCCATGTCGTCATAC
CCTTATAATATGCTTCTAGACGGTTCATGTCTTTCGAAATAGTTGAACCATATTGCACATAATCCCATGGTTGTAATCGTCCTGTGTGTGTCCA
CCAATGCCACGAGTTAAAAACCAGCACGTCCATCCCTTTCCAAGAATTGCCCATTTGAATAGAATCCAGTTTCAGTACCCTACCAATGCTTTCT
CTTACAATATCGACCAAATATGTGGTGCGATATAAATGTATTGTCACTCCATAATCCTGAAATGTAAGAGATGTAAGGGAGTCTTTGTGCTGAA
AATTGGTCTTGGATTTGGGTGCAGCTGCATGAAGCAAACAAGCTAATGATTGCCACATATTCTCACTTAGTGAGTCACCTACAAACATCACCTG
CTTCCCTCTCCATTTGTTCAACAAATCCAGCCCATTAAACCTGGGCAAGTTACACGAGTCAGGTTTCCAAGCATACTTGAGATACTGAGTGTCC
TTGCGGCCATGTTTAAGACAATCGTATCCAGAATCGATATACGGGCAGCTTGAAGCCGCATAGAGTGGATACGAATTATCAACTACCCATTTCC
CCTTATATATGTTACACCCCAACAACTCTCTTCCTCTTATAAAACTACTACTATTAGTAATAGTAGCGATATTATTGGATGATGATGACAAAGG
TACATGTGTTTTCGCTAAAGTCGCAACTAACATAAGTTGCACTTGAAGAACAAGAACTGCACCAGTCAACAAAAGACATCTTCTTTGGTAACCA
AAATCCATGCTTTTATTGGATTTTGGTGAAGGGACTAGTGTGGTGAGAACTATGCTTAATCAATAATTGTGGGTACAAAAGGCTGTCTTGTGCC
CCTTGGTCTCTCATGCCTTTACTATGTTCATTATATATATAGCAAACATTCATGCGCATGACCTATATGACCATACATACACATG

Primers for UN76119 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1CATTATCGTGCCATTAGCCA 59.54320CCGATACATGGAACCAGCTC 60.48320123 106228
2CATTATCGTGCCATTAGCCA 59.54320TGCAGTCATTGGTGTGTTCC 60.5820151 106256
3CATTATCGTGCCATTAGCCA 59.54320GCAGTCATTGGTGTGTTCCA 60.5820150 106255