Simple sequence repeat (SSR)
>UN73820 GAATCATTAAGGTCCAAATTTAATTATAAACATGAGGTCAAATGGGCCTCCAGACAAAACTAAATTACAAGCCACTTTATAATATAAAAACAAC AAAACAGAGCTTTATAAACAGTCGCTATACTTGAACTAAGCTAAAGTAAATGGTCAAAATTCACGTGTCAGCACTTTCTGTAGGTGTTTGCTTT CGTCTTCGTTTTCTTGTAAAGAATGGATCCACCCAGTTTGTATCATCCTTAGCTGCTTTTTCCCATCGCTGTTTAAACGTTTTGAGCTCATTTG TTGATTGCCTTCTAATCTCAGCTCGCGTATCAACAGTGTGTCTCTTAGGCGAATCTGAATTATTCCGAGTCTTTTTAGCAGAGGGTCCACCTAA CGATTGTATTCCCTGGTGAACAACATACTCTCTGTCTACGATTCCCACCTTCTTGGACCGGTCTCCCTGTGCACAGTACCCAAGTTTTATATCC ATTCCCCATCCGTGAACAAGGTCATTTTGAATGAGATGCCAAGCACAATGCCATGCAGCCCTCGAGAAAACCGGAGCCATTCCTTCTACAAATC CTGCACATGGTGGCCCATCACTGGCATCTGAACACTTCACACTGCCTCTGCTGTCATATACTCTCCGATGAAACTTATTTGTTCTCTTCCGAAC CGTAATCCTATGATGTATACCAGTCGAATTTGGATCTAGAGCTGGCTGGGATATCTCTAATCCTTCTGCCTTAACAATATCTAAGTATCTTCTG GGATTAAAATGTTGCACTCCCAGGTCTTCATCCCAAAGAAATATGTAATCATAAATAGACACAGAAGACGGATGCAGAAATCGTTTTGCAAACC ACCACTTTGTTTGGTTCTCGGCTACAATATGTATGGCTTTGTTGCTCCACTCAAGATCCCGCCAGCCATCCATTCTCCCATCATAATGGAACAA AATAATCGTAAAATTTGCTTCAAGAAACTTTTGAGCGATGATATTAACATTCCGCTTCTGTTTTAGACCCACTGGCATTGCCAGCAAGTTATGA GAACTGGTATCATTAGCCTTCAATTTTGAACTACTTGTTGACCACAAAGGTTTTAATTCCAAGTCAGATTTATCTGCAATAATTCCACGTGGTA AACTCTTCAAGCTTGTTGAAGACGACACAGCTTCCTTTGATGTGTAGAACCGATATAATTTTGAATCCAGCTCTGTCTGTATGTATTGATAATT TGTTGTCCTATATACAATGTATAACATTATTGTACAAATTAATCCCATAAACGGCTTCATACTGAATTTGCACAGTCCCCAATCAAAAATAAGT TGTCGTTTCCTCAAAAGATTCCTCCATTGTTTGAATTCCTTCATAGACGAATATTGGTTCTATATCTTCTCATTCCAAACAATTAGATTCGAAC ACGAATGAGTAAACTGAGAATAAAATAATCTGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTGAAGAGTAAAGTTTTTTATTCGGTACAATGAATAAATCCC GGTCGAATATTCCGGCGTGTTTTGCTATGTGTGTGTATTTGTGTGTGTATATATAGATATTCGTATATTTTTAGAGAGAGAGAAAAAGAAAAGA AAGAAGGAGAAAAGTGTCGGAAATGAGGCTCTCC |
Primers for UN73820 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | ACTGAATTTGCACAGTCCCC | 59.973 | 20 | GGAATATTCGACCGGGATTT | 59.984 | 20 | 235 | 1283 | 1517 |
2 | ACTGAATTTGCACAGTCCCC | 59.973 | 20 | CGACCGGGATTTATTCATTG | 60.146 | 20 | 227 | 1283 | 1509 |
3 | ACTGAATTTGCACAGTCCCC | 59.973 | 20 | CACACATAGCAAAACACGCC | 60.18 | 20 | 255 | 1283 | 1537 |