Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN73820
GAATCATTAAGGTCCAAATTTAATTATAAACATGAGGTCAAATGGGCCTCCAGACAAAACTAAATTACAAGCCACTTTATAATATAAAAACAAC
AAAACAGAGCTTTATAAACAGTCGCTATACTTGAACTAAGCTAAAGTAAATGGTCAAAATTCACGTGTCAGCACTTTCTGTAGGTGTTTGCTTT
CGTCTTCGTTTTCTTGTAAAGAATGGATCCACCCAGTTTGTATCATCCTTAGCTGCTTTTTCCCATCGCTGTTTAAACGTTTTGAGCTCATTTG
TTGATTGCCTTCTAATCTCAGCTCGCGTATCAACAGTGTGTCTCTTAGGCGAATCTGAATTATTCCGAGTCTTTTTAGCAGAGGGTCCACCTAA
CGATTGTATTCCCTGGTGAACAACATACTCTCTGTCTACGATTCCCACCTTCTTGGACCGGTCTCCCTGTGCACAGTACCCAAGTTTTATATCC
ATTCCCCATCCGTGAACAAGGTCATTTTGAATGAGATGCCAAGCACAATGCCATGCAGCCCTCGAGAAAACCGGAGCCATTCCTTCTACAAATC
CTGCACATGGTGGCCCATCACTGGCATCTGAACACTTCACACTGCCTCTGCTGTCATATACTCTCCGATGAAACTTATTTGTTCTCTTCCGAAC
CGTAATCCTATGATGTATACCAGTCGAATTTGGATCTAGAGCTGGCTGGGATATCTCTAATCCTTCTGCCTTAACAATATCTAAGTATCTTCTG
GGATTAAAATGTTGCACTCCCAGGTCTTCATCCCAAAGAAATATGTAATCATAAATAGACACAGAAGACGGATGCAGAAATCGTTTTGCAAACC
ACCACTTTGTTTGGTTCTCGGCTACAATATGTATGGCTTTGTTGCTCCACTCAAGATCCCGCCAGCCATCCATTCTCCCATCATAATGGAACAA
AATAATCGTAAAATTTGCTTCAAGAAACTTTTGAGCGATGATATTAACATTCCGCTTCTGTTTTAGACCCACTGGCATTGCCAGCAAGTTATGA
GAACTGGTATCATTAGCCTTCAATTTTGAACTACTTGTTGACCACAAAGGTTTTAATTCCAAGTCAGATTTATCTGCAATAATTCCACGTGGTA
AACTCTTCAAGCTTGTTGAAGACGACACAGCTTCCTTTGATGTGTAGAACCGATATAATTTTGAATCCAGCTCTGTCTGTATGTATTGATAATT
TGTTGTCCTATATACAATGTATAACATTATTGTACAAATTAATCCCATAAACGGCTTCATACTGAATTTGCACAGTCCCCAATCAAAAATAAGT
TGTCGTTTCCTCAAAAGATTCCTCCATTGTTTGAATTCCTTCATAGACGAATATTGGTTCTATATCTTCTCATTCCAAACAATTAGATTCGAAC
ACGAATGAGTAAACTGAGAATAAAATAATCTGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTGAAGAGTAAAGTTTTTTATTCGGTACAATGAATAAATCCC
GGTCGAATATTCCGGCGTGTTTTGCTATGTGTGTGTATTTGTGTGTGTATATATAGATATTCGTATATTTTTAGAGAGAGAGAAAAAGAAAAGA
AAGAAGGAGAAAAGTGTCGGAAATGAGGCTCTCC

Primers for UN73820 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1ACTGAATTTGCACAGTCCCC 59.97320GGAATATTCGACCGGGATTT 59.98420235 12831517
2ACTGAATTTGCACAGTCCCC 59.97320CGACCGGGATTTATTCATTG 60.14620227 12831509
3ACTGAATTTGCACAGTCCCC 59.97320CACACATAGCAAAACACGCC 60.1820255 12831537