Simple sequence repeat (SSR)
| >UN04122 AAGTTTGTACATGAAAAACGTTCCTCGTATAACACCAAATTTACATACAAAAGTTGGATAAAAAGTTAAAACCCAAAACACACAAGCCAAACAT AGCCAGGTTATTTAAACGTTAATAATACTAGTAACAATGAATAGATTGAAAACCGAAACACTGAACAGGAAAATAAAATGTTCAATACAACCAT GAGCTGGTCAGCGTGCACTTACAAGAAACGGGTGCTGGCAAACTCCACATTCTATAGTCTCGGATCCCGAGCTAGGAACTTGAACCTGCAAATG AACGGTACAGGTGGGACAAGCAACTTCTTTCATCCGCCTGCTAGATCCTTCAGACTTGTAACCTGATGATGGTTTGTGATTTCTTTCCAACTCC TCCTGTAGTTTCTTCGCAAGATCTTCATGACTCTGCAATCCAGAGGATCTGCTGGCAGCAGCTTCCTTAGCACTGCTCAATCTATGAGTAACCT CCAACATGCAACGATCACAAACACGAACTTGAGGAGCATTGTCTTCAGATGTGAGAGCAATTCTTCCATGTGTGCACTTGTCACAAAATATATC TCCACAGTTCCGGCAATGATGCTTCCTATTAAAAGCACTGAAGTCTGATCCACAACCAGTGCACTTCGTAACAGCTTCATCAGGTACCCAATGA TCTTTCTCCTCATTTGGGGGTTTAATTATGTTCATCCAGTCGCCCAAACCTTTTTTCTTTTCAGTTGACTGCTCAGTAACTTTAACAGCATCAA CAGGCCTGCTCCTCCCACCCATCTCCTTAACCTGAAAGGTTGCTGCTGTTATTGTGTCCAGCAATGTGTTTGTAGTGTAACTGTTGGATTGCAG CCTTATACGTCTTGGCTCAATGTCTACAGAACTCTTGGACCAAAACGCAAGGGTAGATGAATCATATACTTCACATCTCGTTACTGTATCAAGA GGATATATTCTTAAGGTCCTGCTGGTAGATGGATCAAGCATTCGGATTCCATCCAATCCAATCTGACAAAGAACATCCATAGTACTCTGTCCAC CGCTCTCCGCCAACAACTTCACCCTAAACTTCTGCACACCGCCTTTCACATCCTCCCTACTCTCCACCTTTGGTACCGCCTTCACAATCTTCGG CGACGACACACTCGAATCCTTACCTCCTAAACCTCCACTACCACCACCAATCGGCCTCCCAAAATCATCAAACACAACTTTCTCCTTCCACGTA CTCGACTTCGCCCCCGTTCCCCTAGCACCATACGGCTCAGCTTTTCCCCCTTGATACGCGTAAACACCATCTCCATACCCACCACCACCACTAC CTCCACCACTCGGCTCGTATCGCGACACCGATGATTCGGTTCGTTTACCGTAATAATCAAATCCCCCAGCTCCAGCCCCTACATCAGACACACT CCTGTTATAATTTCCACCATATCCAGTCTCGTACGATGCCGAAACCGGATTCGGGGGATACTGAAAAGACGAGGTGTGATTTAGCGGAAGTGGA GTTTGGTTGGAGTAATTGATTGGTGGTTGGTGATGATCATAAGATGAATTGTAAGGTGGTTGTGGGTTTGATTGATAAGGAGTGTTTGGAGAAT CGAATTGGGGGAAAATAGGGGGTGTTTGGGAAACAGGATTAGGGTTTGGAATTGGATTTGGGGGAATATAAGATGATGGATCGGGTTGTTGTTG TTGGGAATAAGATTGGTAGTAATCGGATGAAGGTGGTGTTTGGTAAGTGGGGGTGTAGGGTGGAGCAGAGGCGTAAGTTAGCGGTGGTTGTGGT GGATTAGGATTGGGGTTGGGGTTTTGAGGAGGGTAATTGGTGGTGGGGTAATATGAATAATCGCCTGGTTGTTGCATGATTGATTGATTGATTG ATTGATGGATGGATGTAATGAAAGAGGTTTTTCTGGTTTTGTCTAGAGGTAGGAGATGAATGATCAAGTCACAGGAAATTGATAAGAAATGGGT TAA |
Primers for UN04122 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | GGTAAGTGGGGGTGTAGGGT | 59.972 | 20 | TTCCTGTGACTTGATCATTCATCT | 60.004 | 24 | 224 | 1734 | 1957 |
| 2 | GGTGGTTGTGGTGGATTAGG | 60.088 | 20 | TTCCTGTGACTTGATCATTCATCT | 60.004 | 24 | 183 | 1775 | 1957 |
| 3 | GGTGGATTAGGATTGGGGTT | 59.881 | 20 | TTCCTGTGACTTGATCATTCATCT | 60.004 | 24 | 174 | 1784 | 1957 |