Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN71750
TTTTTGATAAAAAAAACCTGTATAAAAAAAGAGCAGACCAGTTCATAAAACATACAGTTCGTTCAAAAGATCATTACATAATCCTAATAAGATC
ATTACAACTTGTCCAGAAAATTACGATAAATTACCATCAGATCATTACATACTTCTTAAGATCATTACAACATATTTTTATCTACAAACTATTC
TTCTAACTTCAACGGCTTCACATGCGTTCACGTTGATCCCTGTGCCTAACTGCTTCAACAATCATGTTCATCTTGACAGAAGAATCAACCTTAT
CAAACTCCATCACACGATCAGGCTGCAACAAATGGATGTGTGTCAGCAACGAAATGCCTATTGAAAGACCTAAACAACTTTCCACTACTTTGTG
TGTGTGTG
AGAGAATTGGAATCAACATGGACTTATATTCAGCTAGCTTAACAATACATTTATTATATATGTCGGTCAATCGGAATCAACAAGGA
CTTATATTCATTAAACATCACAATTTAAGATAGATCGACCAGTAAGCGTCATATTGCTAATTAAGTTTACTCTTACCTTGAACAAGTGACAAGA
TCGAATTTTACCTCGAAGCTCTAGTTCCACAAGTTCTAGCAACTTAGGATCATCAACTGCATCAACTTTATTCAAAAAGCACACTAATGATGGC
ACACCAACATGTTGGACGAGTCCGTCCTCACCACATGTATAAAAGATGTGCGGACTCCCAGGTTCAATAGCTAGTTTATGAGCTCTTACATCAT
GTTTCCCAAGCAGTTTTGGAACCACTTGCCCACGTTCTTGGATAATAGCATGCCTCACCGGCAACGGTATCACCAGGATGAACAGATGATGATT
CGACCTTAGATTTACGCTTACTCGCTGCTATTTCATCTCATATATTCATTATTGATAAAATTTGGGGCTAAAATTAGGGTTAGGTGTGTGTTTA
TGAGAATGATAATCGGATGATAATCAGTTATGGGTGATGATCAATTATGGTTCAAATTGGATTGGAGATGAGAGAGATGAGAGAAATTAGAGAT
GTGTGCGTGTGTGTGTTTGTAAAATGAGAGATGGTTTGAATGAGTGTACGGGATATGACCACGATACCCCTCTTCAATAAATGACAATAGAAAA
AAAAAAT

Primers for UN71750 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1TCCCTGTGCCTAACTGCTTC 60.39720GTTGATTCCGATTGACCGAC 60.32620241 225465
2TGTCAGCAACGAAATGCCTA 60.40120GTTGATTCCGATTGACCGAC 60.32620143 323465
3ACGTTGATCCCTGTGCCTAA 60.51720GTTGATTCCGATTGACCGAC 60.32620248 218465