Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN04048
AATTATATGAGCTCCAACTTCATATTCCGCTCCAGCTAGTTTTGCTAAAAACACCCATAAGCAATGACGAAAATGTTTTCTCCAGGTCCAATTT
TTCCTTCGGTAGCTTCAACTTTGCCTTAAGATAAGCTCCTTCCAGTATATTTGTGTTGCTCTTAACAATGTGTCTTTGCTGATGTTGAATCTTG
GATAAAAAAAAAAATTATCCTTTTTTGCAATTTATGCATCCCACTCAAGAGAGTCCGAACCCGAATTTAGTTTGTGTGTGTCTCTAAGTGCTGC
AAATCAATTTGATGAGATGAAGTGGTTGAACCGTTTGCTTTGTGTGTGTGTGTTTAGGACAGATGGAGAGGTGGAGGAGCTGGAGAAGATGATA
ACGCCACGTAGCTTTGTGTGTGTGTCTT

Primers for UN04048 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1AAGAGAGTCCGAACCCGAAT 60.07420CTCCTCCACCTCTCCATCTG 59.78520127 235361
2TTTGCAATTTATGCATCCCA 59.89820CTCCTCCACCTCTCCATCTG 59.78520150 212361
3GGTCCAATTTTTCCTTCGGT 60.16620CTCCTCCACCTCTCCATCTG 59.78520277 85361