Simple sequence repeat (SSR)
| >UN71268 CGGCCAAACAATTTACTCATTTTAGTCTCAAAAGTACAAAATTTGCAAATTAAACTCATATCGTAACATATAACAAAATCAAAACTCCTAATAT CATCAGTAACAAAATTTGCATATTAAGTAAACTCATATCGTAGTAACATATTAATCCGTGTAAACAAAATTGATATCGTCCGTAACAAAAAAAT ATCTCGAAAACCGTTAATCGTCAAAAATCGCAGTCTAATCTTCGAATCCGATTTGCTTCCAAACCGCGTTACGCACACGGCTCAAATCCCTTCC TTTCAACGTCCTTCCAACTCCTTCATGCACCGAAAAACTCGCCGCCATTTGCTTCGCCAGAAACTCATGCGGCGGTATCCTACACGCGCCATCC TCAAACTCACAGTCATCGTAGCTGTCACCTTTCCGGTTCTCACGGTAGTCCTGTTTCAGTATCTTGGACCAGTCTGGTACGTTCACTGGCAAGG ATGAGGGTGTGGTGATGTTCACCGGAGATGATGATGATTTGGTTGAGATCATGCGTTTGGTGTGTTTTTTTGGTGGTGAGGTGGTGATGTGGTG GTTCCAGACGTCGGATTCGTCGAGTTCGAAGTCGGAGATGGTGGTGGTGGTGGTGGTCGTGTGGTGGGTGGTGAGGTAGCGGTGGTGGGATCTA GTGAAGGTTTTTGATGCTGCCATTGAAATGGAGGTTTGTATGTATGTGTGTTTTTGGAGGTGTTTTT |
Primers for UN71268 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | TTCACCGGAGATGATGATGA | 60.006 | 20 | TTCAATGGCAGCATCAAAAA | 60.193 | 20 | 198 | 488 | 685 |
| 2 | TTCCGGTTCTCACGGTAGTC | 60.111 | 20 | TTCAATGGCAGCATCAAAAA | 60.193 | 20 | 279 | 407 | 685 |
| 3 | GAGATCATGCGTTTGGTGTG | 60.12 | 20 | TTCAATGGCAGCATCAAAAA | 60.193 | 20 | 171 | 515 | 685 |