Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN71251
TTATGTTTGACTTTTGATTTTGACTTTGACTTCTCAAGTAAAATAGTCATATAAAATAAAAAAGATACACAAGGATACAATGAATTATAGTCTT
CTACACTACAAAACTCTACTTTTAGTACCTAAGTCCTTTGGCAACCTCAAAAAAATGAGCAACATTTTCCTCGGGTGTACCTACTTTAATACCA
TGACCAAGATTCAAAATATGCTTACCTTTCCCTGCTTTCGTCACGGTATCATTAATCCTATTAGTGATAAATTCTTTTGACCCAAACAGCACAC
CAGGGTCCACATTCCCCTGAACCGCTATATCAGTTCCTAACCGCTTCCTGCCTTCAGCCATATCCACGGTCCAATCCAAGCTCACCACATCAAC
ACCAGTCAAAGGTAGTCTCTCGAGCAACCCTCCTGACCCACTCGCATATAGTATCAAAGGGAGAGTAGGATGAGTTTGTTTAACCGTGTCAACA
ATTTGCTTCAAGTAAGGGAGACTGAATTCTTCAAAGTCAACTGGGCTGAGCTCTGTTGCCCATGAGTCAAAGATTTGAACAGCTTGTGCACCTT
TGTCAGCTTGGTACTGAATGTATTTGGCCATTGAGGTTGCAAATTTTTGAAGCAGCGCATGGAGGACCTCAGGCTGTGAGAAAGCAAGCTTCTT
AATTTTGGTAAAATTCTTTGACGATCCACCTTCAACCACATATGATGCCAGTGTAAAAGGAGCTCCAACGAAACCGAGAACTGCAGCTTCATTA
TTCACCTCTTTTCTCAAAATTGTCAATGCCTCCCCAACATACGGTACCCATTCTTCCGGAGTGAATTCCTTCACTAGAGCAACATCATCAGCTG
TGCTTATTGGATCAAATATGATGGGACCCTTTCCTTTAACAATGTCAAAGGGTATGTTCATTCCCGGTAGCGGTGTAAGAATGTCTGAAAACAA
TATAACCCCATCAGGTTTAAAGACTTTCCATGGCTGTAGAGAAATCTCAACCACAAGATCGACATTTTCTGATCTTTCACGGAACGAAGGATGC
TTCTCACAAAGGGTTTGATAACTCTTCATGTACCTCCCAGCTTGTCTCATAAGCCAAACGGGGGGTCTCTCTACATCTTCACCACGAACGGCAT
TAAGCAATAGCGGTTCAGTTGTACTGACAGCTCCAGCGGAACAGACGATGCGATTAGGACGAGGAAAAGTTGAATTGGAAACCGAGATCGATGA
GAATGATGGAATCGAGCAGCTGTACATCGTTGACATGATGGATTATTATTATTATTATTATTAAGTGTGGTAAGTGCTAGTGCGGATATGGATG
TGGATATGGATATGATAAATTTACGACGTTGGGACGATGGGCTTTGATCGTTGGAGAGTGTGGCACGTATTGGTGGTGTTGTGCGGTGGTGACG
GTGGTGGGAGGTGGTGATTTGAGGGTGAAATATGGTGGTTGTCATGGTTTAAGGATATGGTGAGAGTTGATATCGTGAAAAA

Primers for UN71251 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1GGAAACCGAGATCGATGAGA 60.15820CACCAATACGTGCCACACTC 60.03220187 12051391
2GATGCGATTAGGACGAGGAA 60.17720CACCAATACGTGCCACACTC 60.03220217 11751391
3TTGTACTGACAGCTCCAGCG 60.19920CACCAATACGTGCCACACTC 60.03220245 11471391