Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN69959
GGCTTGATAAGGTTGGTGACACGGTTATTGGAGTTGAGTGGGTCCGGAGTGTCATGAAGAGGCATTCCAGGTGAAGTATACAAGGGGATATGTA
GTGAAGGATTATTAAGTGCAGGTGATGATGCAACACGAGAATGCAGATGAGTTGGTGTAGAGTTATGATAAGGTTGTAGAGAATTAGCCGAATT
GGAAGAAGCATGATGCCCCAACTTCATAGAGGTACCAAAGAAGTTAGCAAATGAAGAATCTTCAGGGACGTCTGTAGAACTGGAAGTAGTAAAA
GGCGGCTCTAGTGGCCTTTCAATTACAGCAGAGGTAGGTACAGCTTCATGTTGCTCGAACGCACTTTTCTTCACTTTCGGCTGGGGAGAGACCC
TTGAGTATGCACCAAGTATCCTAGTAAAGAGGTTTGCAACATCCTCACACTCACGTGTATTGTAGAACCAAATACCGTTAACTTCTTGAGAAGC
ATTTCGGTATAGTAGATACGGAACTTGAAGTTCAAACTCAAAATCTCCCAGGAGATTCTCCACAAGGTTTTCTGTATTTCTTCGATTCATTACT
ATAAACTGGAACCTCGGTTGAGTGTTTCTCTTAACGACAAATAGAGACCCTTCAACATCCTTGCGACTCCATTGATTCAATTCAACATTGAATT
CATAAAAAGTGACATGAGCAGCAGTGATTAAGATCTCTTCAATAAAAGGATCCATTCTTTGAAGAACAGTAAGATTAAGGATTTTGGTACTGTT
TTGATCTATGTTTGGCATTAATTTACCACCTTGTTGTTGCTGTTGTTGTTGTGACATTTTAATTATTTTATTTTTTGATTTTGAGGTGTTTGTG
TTTGTGTTTGGAACCCTAAAAACTAAACTAAACCCAGTGACAAAGATTAGTCTGTGTGTGTGTGTTTAAAGAGATCGGGTCGGTTGAGG

Primers for UN69959 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1CCACCTTGTTGTTGCTGTTG 60.1920CTCAACCGACCCGATCTCT 60.20719157 778934
2CCACCTTGTTGTTGCTGTTG 60.1920CTCAACCGACCCGATCTCTT 61.55320157 778934
3CCACCTTGTTGTTGCTGTTG 60.1920TCAACCGACCCGATCTCTT 60.60619156 778933