Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN68511
TCTTGGGTAATAATATAGGAAGAAAAAAAATGGTTTTTGGGACAAAACCCTCACAAAATTCCGGTTACATTCATAGATATTGTTACATCCCGTC
AAAGGAACATAATAGGTCTTTAATATCTCATCATATGGTGTTTCAGATTCAATTCAAATATCTCAGTAGTATTCCAGCAGAAAGATCAGCTCAC
AGGCTGCTGCTGATGGTTGTCATAACCGTTTGATCCATAAGCTGATGCATCTGCACCCCCATACATACCTCCGTCCTGATGCTGCTGTCCACCG
TATCCATAGCCACCACCGCCATATCCTTGCTTCGTGTAGTAGTTTCCATTACCACCCATTCTCTGTCTGTTGGCAGGAGTTTTACCCCAAGATA
TACGAACGGTCTGCTTGCCGATCACTGTGCCATGCATGTTCTGAATTGCATCCTCGGCGCTGCTTCTGTTAGCAAATTGAACAAAACCGCATCC
TTTTCCTACAGGTATTTTAACAGATAAAATCTCACCACACAGAGAAAACGTTTGCCTCAAGTCTTCATCAGTGACTTCAGAGTCAAGTCCTCCC
ACAAAAATTGTTGTGTTTGAAGAATCTCCATCAGACTGTTGGTTTTGAGGATTAACAAATGAACCGTTTCCGCCAGTCAATAGCACAGCTTGAG
AAGAAAATTGATTCTGTCCATACTGCTGTTGAGTAGGTGGCTTCTTAGGAGTTGCAACACCGATACGCATAGGCCTGCTTGAACAATACTGACC
ATTCATTTCATTCATAGCTCTTGTTCTTTCATTTTCATCACCAAACCTTACAAAACCATAACCTTTTGAACATCCAGTATTTGTATCAACAACC
ACTTTTGCACCTTTTACAGATGGATATCTACCAGCAAACGTCTCATACAACAATGTATCCGTAACATCAGGAGCTAAATCCCCAATAAATATTG
ATAGATCCGAACCACCATTATTGTCTGCACGTTTTTCACCCGTACTAAAGCTTGCCCAGTTCAAACGGAAAGCTTGATCCGTATTTGGCATTAT
GGTCCCGTTATAGGTTTGAAGAACCTTCTCAGCAGCTTCATGAGATACAAACTCAATGAATCCATAACGCTCTGATTGACCAGTCTGCTTGTTT
CGTATCAGCTTTATAGATGCTACCTCTCCAGTTTGAGCAAAACAAGTCTGAAGATAAGTTTCATCCATCCAAAGCTGCAAATCACCAACCCAAA
CAGTCTTATTATCTTCACTAGTAGTTTGAACAATATTATTATTACTATTTTTAGCAAGTTGCTGATGCTGTTGATATTGAGCTTGTTGTTGTTG
GTAATAAGGCATGTAATGAGGTGGTGGTTGTTGATACATCATGGCAGCAGGATGCATATGTGTTGGATATCCTTGTTGCATAGCTAACCATTGT
TGTTGTTGTTGTTGGGTTGTTATGTCGTTTGTTGGTGGTGGGGTGGTGGTTGTGGGGGTTGTTGGGTTTGCTTGTTGTTGCATATTTGATGGTT
TTTTAAGGTTTGGTTTTGTTTGTGGTGGTGTTTGTGGTGGTTTTAGGGTGGTGGTGGTCGGAGGAAGGAGGAGGA

Primers for UN68511 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1GCAGGATGCATATGTGTTGG 59.95520CACCACCACCCTAAAACCAC 60.12620198 13631560
2GATACATCATGGCAGCAGGA 59.63520AACAAGCAAACCCAACAACC 59.87520138 13491486
3GATACATCATGGCAGCAGGA 59.63520ACCACCCTAAAACCACCACA 60.12620208 13491556