Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN67503
GTTTGTACGTGTGCCGGGTTTTAGTAGTCGGCCTTAACGGGTTCGGGCAAGTGCGTAAACTTTTCATGCATTAACTACTATTATTAAATCATCA
TATATATATAT
AGCAACATCTAACTGACTCTTGTTGGCCTAATTAACAAAAGAAAAAATTCAAAGCTTTGTATTATTACAGCAGTTTCGATTGG
TATAATAGAACCGGACGTAGACGATAGAGTTTAATACTGTTTTTGTTGTTTGAGGTGGTGATGATCAAATACTCACTTGATAAAATCTGACCCG
GTATCTTTGTTCGACATCTTTGGGTTACTTTTAGTGACTCTCATCTTTTGTAGCTGGTTCTTGGATAAGGGTGAATCTCTGAGATCCGGCCGCA
CTCCACAGCTGAAATTGCAGCATGGAATCCGTGGTTGGTTTGGAAGATGATAGAAGTTTTGCACCACTCGTATAGGAAGCCTATCATAGTTAGC
CTTGCAATGTCTTTTCCGTCCACTCACTTTCTTTATTCGTCCAGTTCCTAGTAGACCTACATAACTGAAACTTCACAATGTCGTTGAAACTTCA
GTCGTCCACTGAAACATCAGCTCGGCGCTTAAAGCAAAACTTCATACATGGTCTTCGAGAGAACAAAGCTAAAACGGCATCCTCAGCGACTATA
ATGTGTTGTTCGCAACATTCTCCTTGGCCGTTATCCCTTCATGGGCTGAAGACAGTTGGTCATTCAAATCCCTGAGTTCATATACAACATATAT
CCTGGATCAGTTCTTGGAACAAATTCTGGAGTTAATCCAACCCACCAAGAACCGCCGGCGTTGTCTTTGAATCTTGTAAGGAAATCTAAGGTAA
TCTTTCCAAGGCCTCTCTTGTGGACGACATTAATGAGTACCAGTAGCCCGTCTTTTTTACAATTTGCAGCATACATGGGTCCTTAATGTGGGCC
AACTCGAAGGTTGATTGCTGTCGCATACATGTTCTGCGTGTGCCCCCATTGTTGTTGGCATTCGGCCAGCGTGCCTGCGTTGACGTGCATCACG
TGTAGTATCCGTACCCTGTGCAGACGTCGCCGATGATGAAGCATCGTACGTTTCCGGCACATCTGCTTGCACACTCGCTGTCTTACGGGATTAA
GGAAAGTGTGTTTGACCAGGTGTAGGTGGCGTTGTTATCGGAGTCTATGTTGGTACCGGTATTGCACTATCATTAGGTAATTCAGACAGTCCTC
GTGTATCATTTGTTGGAACGGCCTTGTGGCTTTCGTTCTTAAGTTGGATGTGGTTGAAGATTTCCATTTACTTCGACGTTCGCCTTCATCAACT
TTTTACCGCTGTTGTTCAATACCAAATGTCCTGAACCTCGAAACCCGGAAAAAGAAACACGATTAAACTCAAAGCCAACAAATTTTATGTATAT
TAATTTTAGGATACAAAACGCTGGCACTTGCTGTTGTTTAGGGCTATTCCGTTTCTCCTCAGCCCAATATGAGCCTCAGACGGACAGAGGATAT
GGCCAACATGGCTGCAAGTATAGTAACCTGCCCCGCCAAGATATGGACCGTCTCAGCTTTAATCCCCTTGCCACCATAAACTCATCATTTTAGC
ATTACTTAGTCAATACGGTTAGACCTATTGTGGAGTTAAAGGGGCGTGCAGTTTCAGCAAAAAGCACCATATTAGGCCTTTCAAAACTGTAGTG
AACCAAGTAGTCGAATATGCAGTGTAATTTCGTTATAAATTTTATAATTATTGGGCTCGATGACACCATTTTTGGCTGCAACCGTTACCGGGA

Primers for UN67503 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1AGTAGTCGGCCTTAACGGGT 60.01920TCGAACAAAGATACCGGGTC 59.93320274 23296
2TAGTAGTCGGCCTTAACGGG 59.24420TCGAACAAAGATACCGGGTC 59.93320275 22296
3AGTAGTCGGCCTTAACGGGT 60.01920TGTCGAACAAAGATACCGGG 60.88320276 23298