Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN67243
TACATACTCAACTAATTAATATCCTAATCAACTCATCATAGATTAAATCTGGTTTAAGTTACGTTTACAACAAAGGCATAGAGGAAGCGATAAA
CGTTGATCCAAGGAGACAGTTATCCGTTCTTGGGCTGCTTCCAGCGCTACTATTAGAAACTGACCCGAACCCATTCTTTTGTAGCACCCCAGTT
GGAGACAATGTCATTTGTTGGCTACTTTCCCAACTATCTGTCATTAAGTTCAAAGCGGATGGGCTAGTGTTTGTACTAGGATTCAACGCTTCAC
CTAACGGACCCCCCATTGATGTTTCCCAAGAAACAGGAATCCAGTTTACTTGTTGTGACCTATCAATGGATGCATTGTTGTTGTTGTTGGTATT
ATTCACTCCCAATCCCATTCTTAGAGGTGAAAGGTTGCGTTTATCACTGATTGGGGATGAAGTTGATGACATGAAATCTGAGGGAGCCACTGGA
ATGGAGATTGAGAGTTGGGTTCGGTCCGAATGTGGCCAATCATCTATAAACTGGCGAAGCGAGTTTTGGGGCTTTTGAGTTAAGTTGTCAGTTT
TTGACAATGGGTTGAGTAAGGAGTCAGAACAAACAAGCCCAAACTCAGAAGGGGCTGGAAGTGGGTTTGGTTTTAGTCCCATTGATGGAGATAA
CATGGTATTTGAATGGGAATATGCCGAAGGATTTATAGGCAAGCGGCTAAGTATGGTGGAGCTAGTTGTGGTGTTGGCTAACGCTGCTGCTGAA
GCTGAAACCTTGGCGGTGGCAGTGGCTGTAATGTTGGTGTTGGTAGGTCCGTTGGAGACGGAATGGCCAGTTTGACCTTCCACAGGCTTTCTTG
AACGATGACGGCCTCTGTTCATATGCCGCTCGCAGTACTTCTGATCTGCAACCGCGTCTCTTGAGCATCGCCACTTCTTTCCGTCTGTTCTCCG
GCACCGCCCTGGCTCAGGATCCGAGTTGTTGGAGAACCCCAAATGGAATCCACCCCATCCATAAGCAGCTTGGCGGAGATTAGTTCCGGGATAC
GAAGTATACGCAACAGTTTCGAGTGCTTTTCGGATCGGAATAAGGAGATTAGAGGGAATAGGTGCATTAACAGTTATGTATTTGTAGATCAAGG
CTTGATGTTCTAACTCCATCCATTGTGATGGCGTGAATGGTCCTCTCACCCCAGCTATTACCCCACGCATACCATAACCAGTAGTGTTACGAGT
TTGCTGTGTGTAAGGTGAAGAAAAACTCAGCATATTCTGTGAATCAGAATAAAGAGAGTTACTCAGTTTAGCAACTTT

Primers for UN67243 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1TTAAGTTCAAAGCGGATGGG 60.06720CAATCTCCATTCCAGTGGCT 60.07320249 232480
2TTAAGTTCAAAGCGGATGGG 60.06720CCCCAATCAGTGATAAACGC 60.33120201 232432
3TTAAGTTCAAAGCGGATGGG 60.06720CCCAATCAGTGATAAACGCA 59.54220200 232431