Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN66321
TGAACATATACTTGTTGCGTGGGTCGGAAAATCTTAATTTCAACATCAAGTCCTATCTTGATTCATACGGCTGCTCCACAGATTGAACGCGTAA
TCGCTGCTAATGACCTCCAATTTGAGTCAGCCTAGCCATAAAATCAGGATATTAAAAACACCTGCCAGTGCATATGCTTGTTGGTCGGGTCACA
AAAGCTTAATTTCAACATCAACTCCTATCGTGACTCATACAGCCGGTATACATATTGAGCACGTAATGGCTGCTAATGACCTGGAGTTGCACAG
AAAACACCTTTTCCACCATCTTTTGCTTGCAGTGGTTTCAACGCCTCCTCCATCCACTCTAAAATAGACAACTTGCCACTTTGTCTATGTTCTG
GGCCAGTTAACATTCCTAGTGTAGCAACATCTGTTGAGGGTTGGATTCCCACTATAGAGGCTTTTACAGCAACCGCCAACACCACCATACATCC
ATGTTCAAAGCCTTTAATCATCTAATCATAGTCAGACTAAAAAACCGTGAACGCCTGCTAAAGTGCGCGTCGCCCCTCTTCCGCCCTCGTATTT
TCTGTTACACCAATAGTGTACTAAACCACCATCTTCAAGACCCCATACCATTATTAAGATGTTGGAAAGCTCACGCCAAACCTGAAAAACCTCG
GCATCGAAAACCACAGGTCTGACTTATCACTGATCGGAAACCCAACCGCGCAAGAAAATAAAAGATTCCCTTTGAGACCGCAACCTTTTAATTT
CTGAAATCACGGGAACCATTAAACAGCCGTGCAATAAATCTCATAACTGAAACCCCTATTGTGATTAACTTGATTTCCAAAAGTTCGTGTAAAG
CCAAAACTCATATTCTCCTCATCCGTAATCCACCGAAAACCTGCATCATCCACAGTGACTTTAACCCATACACCCAACTGTAGCAAAAAAACGG
CCGCTGGACCCAAAAACGGGGCACGACGCAAACAGAGGCCCAACAACACTTCTTTATTATCAGGAAAATGGCATTTGCACTACACGTGACGAAG
AAAACCATTTTATATTCCACCGACATTTTTTTATTACTCGTATGTCTGCCGTCCTTCTCATGGACCTTTTGGGTTGCTTCTTTGTATCTTCCAC
TGACCCATCAAAGTTATTGACCCTCGTAGCTCCGAACCTCCAAAAAATTCACACCTGCAAAAACAAAAACCTCACACAATTTTCAGCGTTTTTC
TTTCTTGTTATAATCTGATACTTCTTTTGTGTGTGTGCGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCTGGATGTTGTGGTTAAATGATTGTCG

Primers for UN66321 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1TAGCTCCGAACCTCCAAAAA 59.81720CGACAATCATTTAACCACAACA 58.46422155 11551309
2ACTCGTATGTCTGCCGTCCT 59.75120CGACAATCATTTAACCACAACA 58.46422240 10701309
3CGTATGTCTGCCGTCCTTCT 60.27720CGACAATCATTTAACCACAACA 58.46422237 10731309