Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN03583
TTAATTATAAATATTTTAAGATTTAAAATATTTTCATTCCACATTGATACGAAACAAAACCTCACTACGGAAATGAACAACAAGTTTTACATGA
TACAATTTTTCGAGTTTTCGAATTATACCTCAACTCAACTCGGTCTTTAATAACAATCACACACTGACGTTATCCACACTATCCATGCATTGGA
CAATTCACAAGCTACATACAACACAATATAATCCATGCAAACTTTACAATTTTACACAATTTTACACCATTAAACAGTAGACCTTTCTAGTTGC
CACCACCACCGAACCCACTACCAGTTCCAACACCACTACCGCCACCTTCACCCACTCCTACTCCGACACCCACGCCTCCACCGACGCCATGACC
GCCACCACCTCCCAAGCCTCCTCCACCACCTCCTCCTAGGCCTCCGGCACTTCCTCCACCTACACCACCACCAGCTCCAAACCCTCCGCCATGA
CGTGCACCTCCTCCTAAACCACCGCCTCCGCCGCTACCTCCACCACCACCACCACCGACACCAACACCACCAGATGATGATGATGATTGCATCA
AGAAATTATCCGGTGACGATGACGGTGATGATAATTCCATCCTCCGATCTAATAACTTATTACAATTCCAATAACTATTATTATTATTAT
CCAC
ACTCTGCATATTCTCCAATTATCACCATCTGTATCAATAACAAACCCTAACCCTAACGGTAACGGAACAATTGTCCGTACATTATAACAATAAT
CACATAAACAGATGATGATTGATTAATTAATTGATAATGAATGAATAATGAAATTGATTAGATCTGATGATGAAATTAGACGGTGGATCTTTTG
TGTGTGTGTGTAATTGCGTGTGTATGAAAAAGATATGAAAGAAAGAAAGAAAGAATTTGGGGGTGATGGTGATGATGAAGGTGAATTGCTT

Primers for UN03583 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1TGCACCTCCTCCTAAACCAC 60.11120CGTTACCGTTAGGGTTAGGG 58.51420250 473722
2TGCACCTCCTCCTAAACCAC 60.11120TGTTCCGTTACCGTTAGGGTT 60.62821255 473727
3GTGCACCTCCTCCTAAACCA 60.11120TGTTCCGTTACCGTTAGGGTT 60.62821256 472727