Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN65163
CTACATGATTCCCAGCAGAAGAAAGTCTAATTCTTAAAACAATAATTTGTTACCAAGAATAGAAGTGATTCTGTCTCGTTATTAAGCAGTCTTC
TTCTTCTTTGAAGGTAGCGGAAAGACCACTCGGAAAATCCAACCAGCGAATATTGCACCAATAAATGGACAAATCCAGTAAACGTAAAACTGCT
CCCATGTATTGTGTCGATTGTTAACATATGCCCAACCAAATGCATTGGCAGGATTCATTGAAGGGCCTGTGTAACTGGAACCAGTAACAACCAT
AGTCACAATTGACATAGCAAGCATCCAATTCTTCATGAGTGGGCTTTTGGGGCCCTTGAGGACAATGTAAAGTACCAAAAAGGACATGATGAAA
GTCAACACCCCCTCAGCAATAGCACCAGTATGCAAGTCAACTTTAACAGAGGGTCCGCCGAGCATGTGCATGTGACTCGATGGCATCATCTCGA
CAATTGCTAATGCACCACCAACTGCACCTAACGCCTGAGCAGGAAACCTAACAGCAGCAGAAACAAGACTATCCCTCCCCAAACCAGCAGCATA
AAAAGCAGCAGTACCAGTTGGATTAAAACTGGCCCCACCCAACAAATCACCAATAACACCAAACACAAACAACAAAACAAATATAAGACTAGTA
GTGATGAGCAGTGACGTCATCCCTTTAACTCCAAGATATGCTGCTATGACACTAGTAGCTGCACCTAGACATGATGCACAAAATACCCACATGA
AAGTTAACACTGCGTCTCCTATGGCGGATTTGATGACACCCATGTTTGGTTCTCGGTGTTAATGGATTGGTGGTGATGATGATGATGATGATGC
TGATGGTTGTAGAAGAAATCATCTTTCTTGATAAGGCCTTCAACATTGGAAAACTGTTGAACGTCGCAAGGGATGTTGATAGGTCCACGATGAT
CAAAGCCATATTCCTCCTCAGCTTCTTTTAAGAGCTGAATGAAAAGAGGATGGTAAATATAGATGACAGGTATCACAAACCTCTTTTGCTCTTG
ACCTTCATGTCCAACCATCACAGCCATGCATCCTTTCGGAACATGATGATGATGATGATGATAAAGGATATAATCCTGATTTCAGTATGTGAAT
AGAAGCCATTGTGTGTATGTGTGTGAATTAGGTTTTTGAAAATTAAATAAATACAGAGATAGTAATGATTGAAATGAAGCAAGTGGCAGTGAAG
TTTGTTTGTAAGAGAAGGTTTGTGTGGCGTATGTTAGTGGGTA

Primers for UN65163 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1TTGACCTTCATGTCCAACCA 59.93520CTGCCACTTGCTTCATTTCA 59.98820186 10321217
2TTGACCTTCATGTCCAACCA 59.93520CTTCACTGCCACTTGCTTCA 60.17520191 10321222
3TTGACCTTCATGTCCAACCA 59.93520ACGCCACACAAACCTTCTCT 59.76920221 10321252