Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN65163
CTACATGATTCCCAGCAGAAGAAAGTCTAATTCTTAAAACAATAATTTGTTACCAAGAATAGAAGTGATTCTGTCTCGTTATTAAGCAGTCTTC
TTCTTCTTTGAAGGTAGCGGAAAGACCACTCGGAAAATCCAACCAGCGAATATTGCACCAATAAATGGACAAATCCAGTAAACGTAAAACTGCT
CCCATGTATTGTGTCGATTGTTAACATATGCCCAACCAAATGCATTGGCAGGATTCATTGAAGGGCCTGTGTAACTGGAACCAGTAACAACCAT
AGTCACAATTGACATAGCAAGCATCCAATTCTTCATGAGTGGGCTTTTGGGGCCCTTGAGGACAATGTAAAGTACCAAAAAGGACATGATGAAA
GTCAACACCCCCTCAGCAATAGCACCAGTATGCAAGTCAACTTTAACAGAGGGTCCGCCGAGCATGTGCATGTGACTCGATGGCATCATCTCGA
CAATTGCTAATGCACCACCAACTGCACCTAACGCCTGAGCAGGAAACCTAACAGCAGCAGAAACAAGACTATCCCTCCCCAAACCAGCAGCATA
AAAAGCAGCAGTACCAGTTGGATTAAAACTGGCCCCACCCAACAAATCACCAATAACACCAAACACAAACAACAAAACAAATATAAGACTAGTA
GTGATGAGCAGTGACGTCATCCCTTTAACTCCAAGATATGCTGCTATGACACTAGTAGCTGCACCTAGACATGATGCACAAAATACCCACATGA
AAGTTAACACTGCGTCTCCTATGGCGGATTTGATGACACCCATGTTTGGTTCTCGGTGTTAATGGATTGGTGGTGATGATGATGATGATGATGC
TGATGGTTGTAGAAGAAATCATCTTTCTTGATAAGGCCTTCAACATTGGAAAACTGTTGAACGTCGCAAGGGATGTTGATAGGTCCACGATGAT
CAAAGCCATATTCCTCCTCAGCTTCTTTTAAGAGCTGAATGAAAAGAGGATGGTAAATATAGATGACAGGTATCACAAACCTCTTTTGCTCTTG
ACCTTCATGTCCAACCATCACAGCCATGCATCCTTTCGGAACATGATGATGATGATGATGATAAAGGATATAATCCTGATTTCAGTATGTGAAT
AGAAGCCATTGTGTGTATGTGTGTGAATTAGGTTTTTGAAAATTAAATAAATACAGAGATAGTAATGATTGAAATGAAGCAAGTGGCAGTGAAG
TTTGTTTGTAAGAGAAGGTTTGTGTGGCGTATGTTAGTGGGTA

Primers for UN65163 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1GTCTCCTATGGCGGATTTGA 60.03620ACCTATCAACATCCCTTGCG 59.95520165 766930
2GTCTCCTATGGCGGATTTGA 60.03620GCTTTGATCATCGTGGACCT 60.08120181 766946
3GTCTCCTATGGCGGATTTGA 60.03620TGCGACGTTCAACAGTTTTC 59.88820149 766914