Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN65137
GTTAGGATCAGAAGACCTTCCAAAATCAGCAAGTTTCCTTGATCTATTAGCCACAAACGATTTAGCATACGACAAATGCGGCACCACCACATCA
CTCCCCTTCCCTTTCATACTCCATAGCCTATTCGGACTCCGACCTCTCACTAACGGACTCAAACAGAATATCCATCCACCTGCACCACCACCTG
TTCCGTTAACTCTCCGTAACGGCGTCTTTTGCGGCGTTTGTTTACAGCTCGTTGACTCAGCCGATTCGTACTCACTCGACTCGTCGTCAAACTC
CTCATCGTTTTCACAATCGGATGATCTCACCGGTGACACGCCTCTGTTCCGTACGAAACGGCGCCGTTGAATCGACGGTGATGACGTCACTGAC
GGATAGTTTCTGTTGTTGTTGTTGTGACTGGATCTGAATAAGTTTGAAAACGATGCGAAGCGGATTAAGTTTTTTTTGGAGGAGGATGATGACG
TGGCATGTCCGATGCATCCGGAGTTTGTTGTTGCGATGATGTGAGGTTGTTGTGGTTGCAGACGTGGCTTGTTTAATTGCCGTTGGATTTGAGG
TGGTTGTGATTGATCGGACGGTGTACTACAAGAGGTGTTGTTTTGGTTGGCTTGTTCTTGAGCTTGGATGATTATGAGGAGACGGTCACGGAGA
CATGAAGCGCATACGCCTGTTAAGCTGGTTAAATCAGTGGTATGTTTTCTACACTTCATTTTTTATAAAAAAAAAAAATTTGTGTTTGTTTTGA
GTTAATTTGAAAGTGTGTGCATATGGTGGTGGTTTGTGGTGGTCGAGGTTTTAGGTGTAGTGC

Primers for UN65137 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1TCGTTTTCACAATCGGATGA 60.04920ACGGCAATTAAACAAGCCAC 60.00320267 287553
2TCATCGTTTTCACAATCGGA 60.04920ACGGCAATTAAACAAGCCAC 60.00320270 284553
3TCATCGTTTTCACAATCGGA 60.04920AACCTCACATCATCGCAACA 60.1220235 284518