Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN64909
CAAAAAACAATCAACTAAAAAACCATACAATACTAGAAACAGATAAAAATAAAACAATATCTGGTCTTGCAAGCACATGTATACTAATGATGTC
CGGGAAGTTTATCTTTAATCTTGTCCATGAAACCTTTCTTCTCGTGTTCTTGCTCCACTTTCATACCCGTTGTTGTTGTTGTTGTCGTTGTTGT
TGTTCTCGGCCTTTTGCATGTTTTGTTCTTGATACACTTTTCGTAACCTCTCGATCTCTTTCTTTAATGCTTCTTGATGCGCATCTTTGAAAAT
CTTGTCTTGAGCCAAAGCTGCTATTCGTTGCTTGAGTGCGCTGTTATCGACATTTAGAACCAATCTTTGGTGGTCCAAAAACGCTACCCGTGGT
GACAATGCGGACACTTCGGTCTGTAATGTGGTAACACTGCGTTCGAGTTCAGAAATGTATTGCAACTTTCTCACTCGTGATCTCTGAGCAGATT
GACGATTTGCCAAAATCCTTTTCACTCTCTTTGGATCAACAATGGTGCTACCATCGCTCGAGAAATTAAAGCATGGTTTAGCCGAATCCATCTC
AGTTTGACAACCACTCCCATCTTCTACCTCACCAGGCTCGTTCTTTGGCTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTCCTGCTGCTGCTCTTGTTGGTGC
TTGTGTTGGTCTAGTGGCAATGTAACCTTCCCCTCATCATTATCACTATTTTGATCCGAAGGCGTAGAAGGATTCGACGAAGATCTGGTCGAGG
TAGGCACATTCGTCCCAACGTCATCAGCAAACATGGAACTAAATTGCTCATCATCCAACCGTTCAA

Primers for UN64909 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1CTTCTCGTGTTCTTGCTCCA 59.16120GTCGATAACAGCGCACTCAA 60.01920202 132333
2CTTCTCGTGTTCTTGCTCCA 59.16120TCGATAACAGCGCACTCAAG 60.15720201 132332
3CTTCTCGTGTTCTTGCTCCA 59.16120GATAACAGCGCACTCAAGCA 60.16520199 132330