Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN64514
CTCACACTCTTATTGCAGTGACCAGTTGTTGACTGAAGCTGAAGTGGTATAATACGTATTCTACAAAACATTCCCTCTTTGTTTCACCTGGCCC
CATAAATATTACGTTCATGTATTGAAATTTGTGAGAGGAGATATTAATATAGTGGATTAAGGAGGTTATAAACTAGTGGCTCACTTCTTGCGTT
TGCTTTTTACAGCGGTGGAGGATGAAGGATTACTGTGCCAGTTCCTTTTTCTTTGGTTGATGAACCAATTGTTGATCTGCTTTAGTTGTAATCC
TGTTTCTTGTACCAATCTTGCTTTGTCTTCCTCGGTAGGGTAAGGCCACTTAGAATGGGATTGCCACCAGGCTTTAAGGAGGGAAGTGGTGTCT
CCAGGCAGTTTTCCGGCTCTTCTTTTACGTAGAATTTCTTCTCTGATGTCCACAATTTTCTCCTTATAGCCCTGCTTCAGCTCGTGCTTTAGCT
CTTGTCTAACACGCTCCATTAAAGAACGCTCACTTTCAGTTGGAAGACCAAATCCCATGCTGTCTGAAACATCAAGGCCTCCATCAAATAAGTT
GGCGTCACTATCTACTTGTTCCTCATCATCATCAGACATGGTTGCGCCTGTACCCTCACCAGGTGCCACACCTGTTAAGCTTTGTAATGATTGT
TCAAGCTCCCAACAAGCCATGACTGCTTCCATTGCATGAACACGAACATGTTGCTGCAGTTGTTCTTTAAATGAAGAGAGCAATACAACATAAT
GTGCCATAAACTGATTAAGCTCCTTGTCATCAACAGGCTGATTATGATTCCCGAAAACAGAGTACTTAGCAACAACCTGGTCACTCTGAGCCAA
CTGAGCATCAATCCTAGGCAACTGATCAACAGGAGTAGCAATCCTTAAACACGACACGTGTGCCGACAACAACTGATCATACATAGGATGAGAC
AATATATCTGCTTTACATTTAACGAACTCCCAGTTTCTCTCACTCCCATTATCATTTACACCCCGTTGACTTAACTTATGCTGCTCATTTGCTA
TACTACTATCATTATTATTATTACTATCTGGTGCTCCAAACATGGATGAAGACTCACGATGATGATCAAGTGATGTAGTGACTCTAGGAGACAG
CCAGTTTGAGTTGGATGAGTCTGAGTTAGTTGTTTGCAGGTGAAGGAAGTTGGTAGGACTTGTGGTGACGTCAGCATGGGTGGTGTAAGAGTTG
TTGTGCTGACTGAGAATTGCACTGTTGAGCCATGTGGGTGGTGGTGATTGTGAGGTTTTTGGTGAGTGGTGGTCAGAGGGTGGTGGGAGGATGG
TGTCTATGTTTTCCGGTAGGTGGTGATGGTCGGAGTAGTGGTGGAGAGCCATTTCGTCGTGGAAAGACATTTTTCTAGAGAGAGAGAGAAAGAG
AAAGAGAAAGTTTGTTTTAGAGAGAGAGATGGAAATGT

Primers for UN64514 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1GTGAGTGGTGGTCAGAGGGT 60.00620CATTTCCATCTCTCTCTCTAAAACAA 59.3826164 12841447
2TTTGGTGAGTGGTGGTCAGA 60.12920CATTTCCATCTCTCTCTCTAAAACAA 59.3826168 12801447
3GTGAGTGGTGGTCAGAGGGT 60.00620CATTTCCATCTCTCTCTCTAAAACA 58.17625164 12841447