Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN63885
CCTCAATCAGTTTATCAAAATTTGCTTAAATCAAACACCCTCAAAGTAAGAAATTTGGAACATAATCATACCATTAGATCCAAATCCAATAAGC
ATATATTCTTATAATAAGCAATCTGAATATAAATAAAACAAAAATAAAATAAAAAAGTGAGAAACGACCTGAGCCGAAGGAATAAATGGGAGAT
GGTGGTACAGAACATGGTTGGTTTGGTGAGAGTGTGGTGGTTACAGCGGTGGTGGTGGTGGTTCAGAATGATTAAAATCTTAGTAATACCTCAA
CTACAGGTTTTGCAACAACTTCATAATACGCAGCTCAATGTTCCTTTCTTCATTCATTGCTTTCTTTAATGATTATCTGGTTTTCTGGACAATA
CCAACCTTAGACTTCTGCTATTCGGTCAAACTTATCATTTCGTCCTTGCCGCTCTTCCTTATCTTCTCATCCACTCATCTTTAACATTCTTGCG
CAATTCCATGGGTTTATGAGTTGACACAACACATGTTGGAAATTAAGCCTTTAACCCATCTGTTGTTTTAGCAAGATCGCCAACAATCGATGGA
CTGGTCTTATGTGCCAAATGGTCTTGCTAAGTCAGCACACTACACCATCTCTCCTTTGTATTCGGCTTGCGTCGTGCGGCAAAAATAACATGTG
AGAAGCCCTCAGTT

Primers for UN63885 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1TGAGCCGAAGGAATAAATGG 60.03120AAAGGAACATTGAGCTGCGT 59.88220166 164329
2TGAGCCGAAGGAATAAATGG 60.03120GAAGATAAGGAAGAGCGGCA 59.55120279 164442
3TTGGTTTGGTGAGAGTGTGG 59.56520AAAGGAACATTGAGCTGCGT 59.88220124 206329