Simple sequence repeat (SSR)
| >UN63879 ATATGAGTTATCATTGTTACCATTGTACCCTTGTGTCTCAAAGCCATTTCTAACTCCTCTTGAGTTCACGTTTTGGTTTTCAAGGTTAAGGTCA TAATAGTACTTTCCATTCTCCAAAAACCTAGTGTCACTCATTCCCTGCCTCTCTGGGTTGTACATGTTGACATTGTTGTTATACCCTCCCCTGC CATTGGTATTGTACCTATCATATGAGTTATCATTGTTGGTTGTAGTATACTTGTTCTCACCCAAGCCTTGGTTCCTTGAGTTGTACATCTCTTG GTTGTAGCCATTCACACCTTGCTTTTGGTTGTTGAACACATCATTACCACTCTCTTGAGTCTCCACAAACCTTGCACCATCAAAACGTTGACCA CCATAAGAGTACTTACCATTGTTCAAAAACCTAGTGTCACTCATCCCTTGCTTCTCATAGTTGTTATACATATTGCCACCATTTGTTGCCACCT CTTGCTTGCCAGTGTTGTACATATTGTCATCATTTGTTTGCATGAACTCTTCTTGGTTTTGAGAGTTGTACATGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTC ACCCTTGTAGGCTTGTGGCTCATAGCTAAATTCATTAGGGATGTCTTGGGTACTACTATGAATTGGTGTGGTGTATGCCACAGGGTTGTAGTTT TCGGGTAGGTTGGCGGGTAGGTAATTATTGTTATTATTGTTGTTTTCAAGGTTATTGTTGGTAGTGGTTGCGGACGGTGGAAGTTGGCCAGATT CGTGGCCAAACAATCCGTAACCACTACCTTCAGTAGTTTCTCGGGTTTGTGGGACAAATTTTAGGTCTTGCTCATTGGTGTTTTGATTAGTGTT CAAGGGTTGTGATTCTTGAGGGATGTTGTTAGAGACTTTAGCAAAGAATTGGCTTTCTCTTGCATGGATGGTGGTGAGTGAGAGTGCTAGGGTT AGGAAAACAAAGAATGCAATGGAAGCCATTGGAGAGTGTTTTTTGGTCTTTGTGGTTCGAGTTTGTATGTATTCTTGGTTTATATAGCA |
Primers for UN63879 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | ATTTGTTGCCACCTCTTGCT | 59.74 | 20 | AATTACCTACCCGCCAACCT | 59.725 | 20 | 228 | 457 | 684 |
| 2 | ACCATTTGTTGCCACCTCTT | 59.454 | 20 | AATTACCTACCCGCCAACCT | 59.725 | 20 | 231 | 454 | 684 |
| 3 | ATTTGTTGCCACCTCTTGCT | 59.74 | 20 | ACAACCCTGTGGCATACACC | 60.7 | 20 | 197 | 457 | 653 |