Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN63709
CAAAAGGGGAAACAGTTGAATTACTACCATACTTCGCCATCTTCAGCTTCTTTCTGATCATCATGATCAACACGTCTATGATCTCTCTTGTATC
TCTTGTGTCGTTCATATTCTATCGGTGGCTGTTGATCCAACTGTTTCGTCTTTTTCCGTTCAGCGCTATGTCTATGAGAATCACGGGACTCATC
CATGCTCATATCATCCGAATAACGCCTCCGATGCTTCTTATCCTTGTCTCTTCCTGACCTATTCTCCTCATGGCTGCCAGACTCTCCTTTATCA
TCACCATTCTCACTATCTGTATCATCTTTCCTACGTTTATCTTTCTTACTTCTACTATCCTTGTCCCTTCTATATTTTTCTGTTCTCCTATCTC
TATCCTTAGCCTTTTCCTCTCTGCGCTTCCGCTCATCTCTTGCTCTCTTTAATTCTGATATGTATTTGTCAAAGATCTCCTTAAAGAAGCTTTC
CTCGGCAGTATACCAGCTTTCAACTTCAAAGAGAGGCAAAAAGTCCTCCCATCGTGAGCACCAAGTGATTTCCTTAGAAGCAGTCAAAGATATA
TAGAAGTCCTCTGCAAGACGTTTACGCCTTTTGGCTTCTTTTTCCTCCCTTTCTCGAACTCTCTCAAGTAGCTCGTCAAATACAATCTTTAAAT
TAACATCTGAAACAGCAGGCGAGCTAATATCTTCAGCAATTGCATTCTTAAAGTCTTCAAGGGTCCATGTAGATAAAACAGAAACCTTTCTCAT
CTTCACTACTTCTTTTATTTTATCCCTGTCGTCGCTGTACTGCTTTTCTAACTCCTCAATTACATCTTCAAATAGTTCCTTCGGGGTGGCACCA
GAACCATTTGATGATAAAGCTGCATATGCAGGTAAATCTTTTACTTTAATCAAATAGTCACGCCAGATAGTTTTTGAAGTAAGCATGCCCAAAG
CACTATGCCCTTCCATTAGCTTGCGGAATTCATCACGATTTTTACGCTCTGTTTTCCTTAAATCTTCCATTCGTAGTTTCCTCTGCTCTTCCTC
CTCCTTCTCTAGTTCACGTATATATTCTTGGAAGATTTCTAGGCGATCGAGTTTTTCAAGACGTGAGCAACTTTCATTGGTTTCTAAACGATCT
TGCACTCTACGCCACTGACTGCTTGCCGTGATGAAATCACATGACTTCAAAAATTCAATGTACTCCTTTCTGTTTTTCTTGTGCTCTTCTAAAG
CCTTAGACCGCTCCTTTTTCTCAAGTTCCGTTATATGATCATTAAAAAGGTCCTCTCGTTCTTTAGGACGCTCAACAGCTTTGAAGCGATCATC
ATCCTCAAAGATTAAAATTGCTTCTCTCCATTTTGTGGATGATGTAAGGTCCGTTGAATCTTCTAGCATTTTCTTAAAGTCTTCTCGTGCCTTT
TTCTGTTTATGGCGCCTCTCCTCTGCTTCCTGTTTTTTCTTTTGTGCTATAAACTCACTGAAAGCTTGCTTCCGCTCTGCTAGTGTTCTGAGAG
CAGTATACCTTCGGTCCTTAATGATTACTCTCATTGCCTGATCCCATATCCAGTCAGAAGCAATATTTGCAGTTTCTAGAAGGTTCTTGAATGC
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GTTGGCTCAGTTGTATATGTGCTTTTAACTTGTTCACGGGCAAACTTAAGTTCATCAGGTATCCTCCACTTCGATTGTTCAGTAACCTTGTTGT
AATAATACTTTCTTCCATCAGGAGCTTTGTATTCCTTCCAGTTTGTAGTTGCATCAGCTCTCTCAATTGGGCTCATTAAATCGAGAGGCTTCTC
CCAGCTGGACTGCTTTGTCTTTACGTTGTGATAATATCTTTTTCCTTTGTGAGAAGTATGTTCAATCCAATCCGATGGAGCCATTTCCAAAGCT
TTGGGTGGATCAGTTGTTACTGTAATAGAAGGTGCAACTGATGTCTGTTCAGTAGGCGGCAATGGAGGTACTTGTGTAGTTGCTGACGTCGGTA
GTTGATTGTAATTTATAGGAAGGGCCACCGGACCATTCTGACCAGGCATATAATTATTGTTTATTGGAACAGCTTGTTGGGCCTGTGGTGATAT
GATCAGTCTGCTCGGTTGACCATCAGGCACAGAAAAAGCTTGGGCAGCAGGCGGTGGTGGAGGAGGCGTCACTATGCCATGTGCCAGTGGTGGT
GGTGGTGGTCCAGGTCTAGGAGGTAGATGTTGCATCGGCTGAGAAACCATGTTTGGCCTCCCGACAGGTAAATATTGTTGAGACACCATATATG
GGGGTCCTGGGTGTGGCGGACCTGCCGGGCGGAATTGCATTGGCATTGATGGATAAGCGTTTGGAGGAGGTCCCATAGGAGCAACAGGATGTCG
AGGCTGCTGTATGCCAGGATACTGAGAATTATTGGCCATCCAAGAAAACAGAGATTCTCAGTTATTAGGTACGAGTGCAGTGGTTTGGACAAGC
GAAGGGGTTTTGGTTATGTCAGGGAAGAAGAAGAAGCGAAGAAAAAGGAGG

Primers for UN63709 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1ATTTATAGGAAGGGCCACCG 60.16420CTCAGCCGATGCAACATCTA 59.97220221 23612581
2TGACCATCAGGCACAGAAAA 60.2420CTCAGCCGATGCAACATCTA 59.97220121 24612581
3TTGACCATCAGGCACAGAAA 60.2420CTCAGCCGATGCAACATCTA 59.97220122 24602581