Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN62572
GCTCCATGCCATTGGCTTCTAACGTAGAGCTTGAAGCCACTACTGTTACAACTTAGCAAGAGAGTGATAGAACTTTGTGCTCTTCTTGGGCGAC
CTCTGGATTTCTTAACCAGATAGCTTTAACATCGTTCAAGCGTTCCCATTCGTATGTTGTTTCCTTGATGGTTTTAGTCTTCGATTTTTCTTCA
TCTTCCTCCTTGTCAGAATCTTCCTCTTCTTTCTCTTCACCCTCTGTGGCTTCGGGTTTTTCTTCCTCATCACTGGAGTCATCTTCATCAGCAG
GCACCTCAACATCAACTTCCTTGCTGGCCCAGAGGTAAATGGGGAAGTTAATGAATTCAGAATACTTTTTCACCAATTCCTTCAATTTTGACTC
CTCTAGGTATTCCCCAGCTTCCTCCCTAAGGTGCAATCTAATTTCAGTTCCACGGCCAAGTGGCTCATTGTATGTATCTTCAGAGATAGCAAAA
GCACCATCAGCCTTCGACTCCCACACATACTGTTTGTCATCGTTGTGTTTGCTGATAACTTCCACATAGTCGGCAACAAGATATACCGAGTAAA
ACCCAACACCAAACTGACCAATAAGGTTAAGATCACCACCTGTCTGCATTTTCTCCACAAAAGCTGAAGTTCCAGACTTGGCAATTGTTCCCAA
GTTCTTAATCAAATCCTCCTTTGTCATACCCACACCTCTATCGCGGATGGAAAGAATTTTGTTTTCTTTGTCTAACTTAATCTGGATTTCAAGC
TTGGTATCATCACCTTCACCCAACACCTCCTTATCAGTAAGAGAAAGGAACCTAATTTTGTCCAAAGCATCAGATGCATTGGAGATTAATTCTC
TTAAGAAAATATCCTTGTTGCTGTAAAGAGAGTTGATAAGGATGTCCATAAGCCGAGATACTTCAGCCTGGAACTCAAACTTCTCCGCATTGCT
ACGGAGATTCTTCCTTGTCATTGACTCGGCTTCCCTCTTGGCGACATCAGAATCAGTGGATAAACCATGCGGAACAGCCCCAAGCTTATCTTCA
ATCTTGGGTGGATCCACTAATTCATCTGTATCAGCTTCAGCATTCGCATGCAGCTTGAAACCAAATAAGCAAGCTCATATGCTGGGAAAATAAG
CTTATTTTCTTTAAGATTATTACGCCTGGATATGGCCAGCAAAACAATCATTACACCTTCATCAAATGAATCAGTAATCAGAAACATCAAGGAA
AGGCCAGATGATTTTTAAAACTCTGATTTTTGACAACCGGATGTCGATTTGGGGTTTTTTTCCTGTTTTAAGGGGGTAAGAACACTCAATAAGT
TTCTTATGTTTCATCTTGTTTCCTTTGGGTTTGATGATCTTGTACACCTGTTACCAATCCATGGTACATTCTAAGCAATGAGAACGTACACATG
ATCCAGTGACATACTGGTCGGCCTTATTGTATATCACTATATCGCATCAAAACATTAGGTCGAATACAATACATTAGCTTGGTGTCCGATTGTT
TATTGTGTTTTGATGTAAGTGTCTTTCGTTTGTGTGTGTGTGTTTTTGTGAGCAACAATGTGTGTCAAGAAGGAT

Primers for UN62572 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1GTGACATACTGGTCGGCCTT 59.99720CCTTCTTGACACACATTGTTGC 60.59222162 14161577
2AGTGACATACTGGTCGGCCT 59.60420CCTTCTTGACACACATTGTTGC 60.59222163 14151577
3TCCAGTGACATACTGGTCGG 59.54520CCTTCTTGACACACATTGTTGC 60.59222166 14121577