Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN62295
TTTTGAGACTTGGGGGTTGAAACATCGACCCAGTCAGAGAGTGGTGTTTGGTTATAGTCAAAGCTTTCATCTGATTTAGGATGTTCCTTTTGCA
TTGATTGGTCCTCTGGTGACGGTTTCCTTTTCTCACCCTGTAATAGGTGATCAGGTGTATGGTCAGAGCTGTCACCTGAAGCCGTTGCTGCTGC
TGCTGCCATTACTGGGGGGTCTGCAACCTGTGTCTTGTTATCTTCCTCCTCCACTAGCAGAAGGGGAGGATGAGTCTGTAACGGCATGGGGTTT
GGTGGTAATTTAGGACTGGTGTTGAGACGGCGCTTGTTGATTGATTCCTCCTCGTCCTTGTCCTTGTCGTCGTTGTCGTCATGGCGTGGCCTTT
TCCTTTTGATTGTATCTTGTGGCGAAAGGTCAACATCGTCGTTGTTGTCATCATCATCGCCATTGTGATGATAAGAAGCAGGAGGAGGAGGAGG
AGG
GTTATTATTAAGTTGGGGTTTGGAATTCAAAGGGAGTGGGGTTTGTAAGTTGGGGTATTTCTTATGGAGGAATTGTTTTTCGAGTTGGAGA
GCATCGAGAATGGCATCTACCCTGCTGGCGTATTTTTGTTGTTTCTTAGGACGCATGCCTTGGGAGGCTTGGGCGCGCTGAATGCAGTCGTCAA
ACTCGCTGCAGCGGAAGGGCTTAACGCGCTTGGACTTTTCGAGGTTAAACCAATCAACGCTGGCATCTTTTCTGCCAAGATATTTAATAGGAGT
ACCAGGTCGGGGAGACATCAAATCAGAAGCAGAAAATTCTTCATCGGCCAGAATCTTACCC

Primers for UN62295 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1TGATTGATTCCTCCTCGTCC 60.01120ATACGCCAGCAGGGTAGATG 60.11820278 320597
2TGGCCTTTTCCTTTTGATTG 60.04620ATACGCCAGCAGGGTAGATG 60.11820229 369597
3TGATTGATTCCTCCTCGTCC 60.01120TACAAACCCCACTCCCTTTG 59.82420201 320520