Simple sequence repeat (SSR)
| >UN03315 TCAATGCACAGTGCATTGCCTGTTGTTAAATGTCGCGAAAAAAAGCAATAATAATAATAATATTAAATTTAAAGTTCACTGATTACATTCCTAG AGAAACTGGACCTTGGTTAGTCCTAAGCTTTAACCGAGCAGCACTCCACGATTACCGCCAAAATGTGCATCCTCCTAATTAATACAGATAACCT AAATGATATTAGTTTCTCCAATTGTGCATAAACTTAAGCCTCCATATCCTCATCTTTTTCACCCTCCTCATAACCTTTGCACCTTATGATATAA ACCTTAAAGACAGTTGGCTCGATTAGCTGGAAAACAAGTGCATCACCATCCACCAATTCATGACTGATGGAGAAACCCTTCCATCCACCACTAA GCCATTTGTAATCCGAATTCACAGCCAGGAACTCATCACCTTCTTCATCAATTAAAGTAATTGCACCATCCTTCGGAAGGTATTTCCTACAGAA GTGAGCTGGAAGGTTCAACTGGGTACCAGTGACATATGACTTAACGATGGGCTTGACGAACGAAGGATAACCATCTTCAAGACTAGCTTCAAGT TCTTCGGCTTTTGTTGCAGCCCAACACCTTGCTTCACGGTTTCCTAAACGCTTCCGGACATAGCTATACTTACTTCCACTTTTTATTATGGTAA CTCGCTCATAAATAACACTTTCTTTGTGGTCAGGGTCAGGCAAACTTGCAACACGGCTCGACCTCCTGACCTCTAAAATTTCTGTCCCTAAGAC ACGAGGTTTTTCACGCTTCATCGGAGAGGGTGTCGGAGAGTGACCGGCTTTAAGCTTTAGAGCAAGCAGCGGAAGATTAAGCTCTCTCACTTTT TTTTTATTCTCTTCCAATCGCTTGTTGCGTAAATCTTCATAGTTTTCTTTCGACATTACCATTTTGTTACTGGATGTTTTCTTTACAGGGAAAA AAGATTTCATTTTTAGGGTTTTA |
Primers for UN03315 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | TGCCTGTTGTTAAATGTCGC | 59.735 | 20 | GGAGTGCTGCTCGGTTAAAG | 60.015 | 20 | 125 | 17 | 141 |
| 2 | TGCCTGTTGTTAAATGTCGC | 59.735 | 20 | TGCAAAGGTTATGAGGAGGG | 60.066 | 20 | 253 | 17 | 269 |
| 3 | TGCCTGTTGTTAAATGTCGC | 59.735 | 20 | GAGTGCTGCTCGGTTAAAGC | 60.162 | 20 | 124 | 17 | 140 |