Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN59856
CATAAAGTTAAGAAATATTATTATTTCATCTCCAAGCTTCTATAGTCCAAAGCGCCATTTTTTATTTTAAAGAAATCAAAACCAACGTTGTTGT
TGTTGTT
ACCACTTGTACCATTAGTACTACACCTGCATTCCTTGTTATCTTGTACACCTAAACTGCACGCAAAACATATTGTTCCACCAGTCAT
CAAAGGTTGTTGCATGTATGATATTGACGGTATCATATTACTACTATGATGTTGTGGTGGGCCAATTCTTAACTCCAAGTTCAAATCTGGACAT
CTTTCTTGTTTTTGATCAGGTGAGGTTATATTGAGCTTAGTGTCTTGTTCCATGTCTTCATTTTTTACTACATGGTCTGTTGTTTTTGTGGTTG
CAAAAGATATGATGTCTGGTGGTGGTGAGGTGACATTATGGTTGTTGTTCACGGTAGTGGGGACGGTGGTTGTGGTGGTCGCGGGCGTGGTGGG
GTGGTCGGTGACTGGGCGGTGAGTTGCTGGATCAATTCCACGGTTTAGAAGCTTTCTTTTGATGTGTGTGTTCCAGTAGTTTTTTATCTCGTTA
TCTGTTCTTCCTGGCAATCTTCCAGCTATTAAAGACCACTTGTTGCCAAGGAGGCTATGAAGTTTGATAATAAGTTCATCTTCATCTTCAGTAA
AATTGCCACGTTTAAGATCAGGGCGAAGATAATTGATCCACCTGAGTCGACAGCTTTTACCACACCTTAAAAGGCCAGCAGCTTTAGGTAGTGA
CCTCCAGCAGCCTTCACCATGAGTTCTTATATAAGCTATTAACCGATCATCTTCTTCTTTGGTCCATGCA

Primers for UN59856 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1TAGTCCAAAGCGCCATTTTT 59.7220TGTTTTGCGTGCAGTTTAGG 59.91120128 43170
2TAGTCCAAAGCGCCATTTTT 59.7220TTTTGCGTGCAGTTTAGGTG 59.91120126 43168
3TAGTCCAAAGCGCCATTTTT 59.7220AGTTAAGAATTGGCCCACCA 59.42920220 43262