Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN59855
ACTCGATTCCACACATCTTGGTTGTTCAGCACCAGTGACTGAATAAAAAGATCATTTCATCACACACGTCGAATATCATCCACCCGGTCTATAA
CATCCAAAGCCTTAATCCTATCGACATCAAAGTTGATAACCGGAACAGATGAAGGTCTCTTGATTGGAAAAGGATCCCTCTTAATTTCCCTTGT
TGGGGAATGACTACTGCTCTTGGTTAGCCTATGGTGCTTGCTTAACCTGTTCCGGGTATCAAATTCTTGACTTTTGCTTATTCCCGGGGTTAAC
TTCCTTTTGCTTACGTCCCGAAGCATCTCTCGGTCTTCAGATGTCAGCCCTGGCAGTGGGGAGTTGGGCCTGTTTGTTGAAAGTTGAAGTCCTA
TTTGATTTGGGGAGCGAATTGGGGATTTAACAGGTGATCTCATTCCACCGTTTATAGCCCTTGATTGTAAGACAAGATGATGAAGCCATACTAT
TAATTCAAGAATACATTCTTCTGTTTTTTCCTTATCTGCATGGTGGAGAGTCTCTATTCGTAATGAGTCAATCGGGCAAGAAGGTTTTCGGTTT
GCCTCAGATCCTGTATTTGCCCATTCTCCAACCCAGCCGAAGCCATGATGAGCTTTTGTTGTGTTTGTTGCAATTGGAACGAGCCATTGCAGAG
TTTTCTCCATCTCCGCTTTAATGTCAGGGATGGTAAGCTCTTCTTTTGGCTGAAACGAATGTAATCTGGAGCGCATTGCTAACTTAATATTAGG
CGGCAGTCCTTGGTACAAAGAATCCCTAGTACTTGGAGGCACAGAACTTGAGCGAGTAACCAGTGTATCAATCTGTGTAATAATATTAGCATAA
TGCAGTGCTAGACCAGCTGCTCCCAGTTTCTGTCGATTGCTTTTTACTGGCGCTTGTGTATCAGCTGTTCCAAAAGCATTGTGAATCTCCATGT
GTAAGAAATGAACAATATCTACAAGTTGCTCCATTACCTCTTCCAAAATTCTAGACCAAAGTGACTTCTTTTGCAAACTTCTGACATGCTTCTT
CTGACTTTTCAAATCTGCCCTCAAGATAGCAAGGCTGTCCCCTCTTGGAGGAGCATTTGGGTTCTCCTCTTCTTGTTGCTTACGTCGAAAATCT
TGTTCAAACCTGTCCAATGCATGTAACTCATGGTACAACTCCGCAGTATACTGAACCAAGATCTTCAAATGCTCCATTATTGTTTCTGCTTCTT
CTTTCAGTTGCTTCTGAGGAATAAGTTCTGATCCCAATTTTTCAAAATATCGGTCCAAATTGTGCCATTGAGGATCTTTGCAGCGATTTCCGAA
ACGAACCACTTCTCCAGAAAAGATTTTTAGTTCTTCCCTCTTATCAGCTGCAGCTATTCTAAGGAGCTCATCCATGTCTTTAGATATCAAGCAT
TGCACGCCTTCTGAAGGCAACACGACCTCTTTTAAGTGTTTTATGTTATCCTTTGAAAGGGATTGCATAAGGTTGGCACCCTTAACGATCGTGT
TGGCAACTTCAAAGGACAATATTGTAATTTTATTTCCCTTTGCTGCCACCCCCGACACAAAACCACTGCTGACATGCAAGCTTGTCATGCTGCT
ACCAAGTGTATCCAGCACTTCTACCGCCTTTCCAAAACCAGCAGTGCCAGCTTTACCCAAAAGCGAACTCACTTCTGAAACCTTATTAACATGA
GGCAAGTTGGATTTATGCGCTCTAGACTTATGCGATAACGCCCTGGACAATCTGGGAATCCCATCATTATCATCCATAGCAAAAGACTCACCAT
TCATCTCCGGAAAGGAAAACGCCTCCTTGGTGACTCCCCTCTTATTACTCTCCTCCACTGCCACGTCATCCCTCCTGGCCTCCACAGTGACAGG
CACCCCTCGTGTTTGATAAACCACACCAGAACCATAATTTATCCCATTCTCTTCAGTAGATCTCCTAGAACATAATCCACCCATATCTAACTAG
ATAATTACACACACACACTAATTACTAATTCAACTTCATTTCATGGTAACAGAGTGGTGAGATTAAATAGTGTTTGGTGATTGTGATGATGATG
AAGATGAGTTGCTATTTTTAGGTATCGGTGTTGGTGATATTTCGAGGGATTCAATTTCTTTTCTTCTTGTTTTTCTGGTCAA

Primers for UN59855 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1GCACCCCTCGTGTTTGATAA 60.89420TCGAAATATCACCAACACCG 59.39520234 18802113
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3CTCCACAGTGACAGGCACC 60.31119TCGAAATATCACCAACACCG 59.39520248 18662113