Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN59723
CAAAAAGATAAATGCAGCTACTGTATGTTAAGATAGATATGTTAATGAGCTTAAAAAAATAACATGCTGATTGCTACCACTAGCCATAATAGAT
GATCACCTTTGATAAAATCTAGATAATCAATTGTTCGCTTCTCAATCTTGACCATACACTTGCCACCAGCAGAAGTAGAAGCTGATGTTGCTGA
CTTTCCCGTTTGCAGTGTAACTCTAGTTTCTGAACTTCCACCATAAGCACCAGTCCACCACCACCACCACTGTCACAACAACCGTAACCTCCAC
CATCACCATCATGACATGTAATGCCTTTATACACACGACTCATCCAAACGCACTAACAATATGCCAACCGAATAATCTGAATCCATAGATTAAA
ATCACATAAAAGTTCCTTCAGCTCAAGATTGAAAGTTAGGGTTTAGATCGAATTGATGTAAAATTGTTTTGTTGGATCGAATTGATGGATTGAA
AGTATTAAAGAATCAAAGGAGATGAGGAATGAAGGAGTTGTTGTTGGATCCTTTTTTTTT

Primers for UN59723 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1GATGTTGCTGACTTTCCCGT 60.11920ATGATGGTGATGGTGGAGGT 60.05620117 178294
2GACTTTCCCGTTTGCAGTGT 60.15620ATGATGGTGATGGTGGAGGT 60.05620108 187294
3GATGTTGCTGACTTTCCCGT 60.11920TAGTGCGTTTGGATGAGTCG 59.86420160 178337