Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN59174
ATAAAAATGAGATTGAATATAAATCGAGATAAATTAAATGAAGAATGTAAATGGTGTGTAAAGAATCACGGTTTTCTCCAATACTACCTTTTAA
GCAGCTCAGTGAAAAAGCTTCAAGCACAGCCTGTTTGAACATTTCTTGCTCGTGATGACTTCAGAGAATGTATCAACAAGTTGCTCCGCAAGCA
AAGCTGGATCGTCCATAAATGTGTCCACAAACACCTTTACTATTCTAACCTCTTGTGGACTCGCTCTCAAGCTGTACCAAGTGAGAAATTTCTG
TCTAAAACTTGTATCTATATGCTGGTTACACTCTAACGATCTGATCACTTTCACATAATATTCGAAATCCCTATCTTGCTCTTCTTCACCACTC
CTCTTTTTTGAAGAGCTACCATCTTGTTCCTTACCAGACCCATCATCAAGATTGTTTTTTGAAGGTTCTGGTCTCGATTTTCTTGCTATTTTAC
CATCTTTTGAGCTTTCTGCTTTGCAAGGAGAAATGGGTAATTCGACTTCTGTCATGTGAGCAAACTGATCAGTTTTTTTCCCATTTTCGATAGT
GTCATCCTTATCATCTGGAGCAATATTTTCTGTTTCATTACAGTTGTTTGATTGTTTCTCCTTCGGGTCTTTGTAGCCAGCAATGTTGTTATTT
TCATCTTCGACTGAAGAGGGATTCGAAAGACTGCTAGAATTCGTTGCCAGACTTTGACTTCGTTTAAGTTTCTCATTATCTTTGACAACAGGAT
CATGAGTGTGAGACAGAACTGAATCAAGACACTCGACTGCAACTTTGCATAGTCTCTGAACCTCTTGACCAGAAGCGAGCCGGTTGATAATACC
CCTGGCTTGTCTGACTGGCAAACCGGTTAAGGGGCCTACATCTGCTTTCAGTATTTCAATTATTTCTTTCACAATTTTGTGAAGATTCTCATGA
CGCACGGTCCCGCTCAAGAGCTTCTGGCTCAAAGAAGCCCGATAGCACAAAATGTCAACTCGCCTGGTGTCCCTTGCTATAGTCATTTGTTTTC
GCCAACATTGGAGCAAATCATTCACTTTACCACACGATATACAGTAAAAGCTCCCATCTAGTCCTCTGCTATGCTCATCTTTTGGAATGCCAGA
TTTTTCATGTTGTAAGGCACATTCAAGGTGACACGAATACCCACATGACTTTTCCTGATATGGAGGTTCCGAGCTGCAAGTCAGCCATAAACTC
GGGTCCTTGTTGTCATCATATTTATGACAAATGCAGCAAGAACATCGCTTACAGAATTCATCTTCTTGGTATAATTTAGCTCTACAAGCAGAAT
TTTTGCATACTTTCATCTCGTCAGAACTAGTATCAGAATCAACAATGTTGATTACAATATCAGGTTGGTCGGATTTCCTCTGTCTTTTGGTGGC
ATTTTCAAGACCCTCAAGAGTCTTCTTTGATTTTTTTTTATCAGCCACAATTTTAAGAAGGATGTCAATGAGTTTCAATTTTGATACTCCCGTA
TACTTTTTATCTTTTCCTGTTTCGGTGCATAGAAGTTGTAAAATGTCTTGTCGGGTCCATGATTCCAACAGTTCCGGTGCCCCCTGTGACCACT
CTGCTATTTCGTACACGAGTTCTCTCTTTGCCTCCATCCTTAACTTGCTATACTACGATGGATCTAACACAAACCCTTATAAAAACTCAAAGGG
TTCGGTGTTGTTGTTGTTGTTCATCATGTGTTTTTATATCCAACCGTTTTTGTGTATTATTAGTCACGTATAAATAGAGACAAATAAAGCAAGC
ATGTGT

Primers for UN59174 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1CTTTTCCTGTTTCGGTGCAT 60.1120CACATGCTTGCTTTATTTGTCTC 58.95823277 15151791
2TGCCTCCATCCTTAACTTGC 60.21420CACATGCTTGCTTTATTTGTCTC 58.95823165 16271791
3GTCTTGTCGGGTCCATGATT 59.78620CACATGCTTGCTTTATTTGTCTC 58.95823243 15491791