Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN02651
GACAAAAATTGGTATTTAGAATAATGACTGATATATTTGCCAGTCAATTAAATCATGGGCTGTTTCAAATTACAACTACATATATCAGCAGACT
CGAGCTTCATATATATATATGGGTTATACATAAATGGACAACAATACAAGGAACAAGTTGAGTCTTGTCTCACGGGTGCCAATAGTTGCAGGAA
GCTCCCCTCTTGCATCGTCCGCTCTCGTAAAACTTACAAACACGTTGCCCTTTTGGCGGTGGTCTTGAATAACCGACACCGCCATTAACATCAC
TACCACTACCAAATAAAGACTGTCTAACCCAAGGTTTACCGTTCCTATATCCTGAATCCTCAACATTGTAACCTCTTTGACTGAGACTGTTATT
GTTATACCTCTGTTGTGGGTCCCATCCAAATGTCACGCCCTGGCTTGGGTTTAAATGTGTATCGGCTCTAGTAGTGATTTCTGGAGCTGGTTGT
GCAAAATTATTCAAGGTACCTTGTTGTGGAGGTCCTACAGCATCAACCTTTGCAGACTGCAAGGTTACATCAACAGCCATCACATCACTGTGGT
CGGCTCTAACCTTTTCAGAGATTGGGTCTTCTGATTTTGTAGATGCGGATTGGGTGAATTCACTCTCCTTATGTTCGTTTAAACAACCTTCCCT
ATCTTGACTTGTCTCAGAAGCATCATGGCCTGGGCGTATCGGGACAGACTCTTCTTCGATTTGAACATTGCCCACTTTGGTTTGACTTTCACCC
TCAACAGATTTTATAGAATTATTTACATCAATCATGTCTTGCGAGGGAGGTTGAACCTCGGAAGAATGGGCAGTGACCTGGATGTCTTTGGTTA
TATTTTCTCGTGCTATTTCAGGCCACTTAAATGGCAACTGTATATCGATCCCATTGGAACTAAAGCCATTACTTCTTGCACCATGAACAGGGGT
GGGACTGAACTCCTCAAATGACCCATTAAAAATATCCTCTGCAAAATTGTTCCTTCTTGATGTAGGTGAAGGGAAACCATTTTGAGACTCCATC
GCATCCACTTCCGCCAGCAGATCTGAGACAGACTCCTCCGCCAATGTGCTAAACTCGATTGTTTCGCGAACACCTTGCCATGATGACATATAAT
TGTTATATTCAGGCTGTGATGAGGGTGGAGGTGATGAAATAGTTTGCTCAGTGTTGGCGGTTGTAGTAGCAACATGATCATCCTCAGGATGCCA
CTCCTGCTTTTTAACTTGCGTAGGTGAGTATCCACTCCATTCATCAGCTGTTTTGGAAAGCTGGGCTCCACCAACATCTTGTCTTAAATTATTA
TTCCAACTAGTTTCATTCCCAGCTACTTGAACCAAGGTTTCAGAAGACGATTTTGGAACCTGTGCCCCACCAACATCTTGTCTCGAATTGTTAT
TCCAACTAGTTTCATTCCCAGCTACTTGAACCAGGGTTTCAGAAGACGATTTTGGAACCTGTGCCCCACCAACATCTTGTTTCGAACCATTGTT
CCAACTAGCGGCGTTCCCGAAGTCTTGAACCAGCTTTTCAGAAGACTGTTTCGGAAGCTGGGCCCCACCAATATCTTGACTCAAACCAGGATGC
CGTTCCTCCTGCTTAACTTGCGTAGGCGAATATCCACTCCATTCTTCAGCTATTTTGGGAAGCTGGGACCCACCAACATCTTGACTCGAACCAT
TACTCCAACCAGCGGTGTTCCCCGCTTCTGGAACCAGGGTTTCTGAAGACAATATTGGAAGGTGTGCCCGACCAACGTCAGAATTTTCGGATTC
TCGAACCAAAGTTTCTGAAGATGGCAAAGATTGTTCCTTTATAGTATTTTCCACCTTTTCACCTTCAGGGGTTATCTTATTTGGTGTGGGACTT
GGCAAATCGTCGAGTGATGCATTCCCAGCAAAAACCGAAGAGACAGGCTTATTATCAGCACTATTCTCAATCGGTGTAGGACTAGCCATCTCTT
GCATTTTAAACTGTCCAGTTGACTCGATTGACTTTGCAAAACTGCTGGTAATCCGGCCCGATGAGCTTTGACTATCAGATAATAGATTAGTAGT
GCGGACAGTGAGACCCTCGATACGAATACCAACTTTCTCGGTAGCAGTCTTTTTCTGCAACTGCTCTTTCAGTACATCATTTAATAGTAAAGAT
TCATCCTCTCGGTTTATCCATATTCTCATATCAGTCGGGAAGTATCCAGTGGTACTCCATTTCTGCAGCTGTACCATACAAAATGGCCCTTGAA
CTTTTCCACTAGGGTCTCTATAATACCAAACTTTATCTATTTCACTATCGTTGGAAATTGGAGTATTCCTCATAGAGGATGTGGTAGCAGTTTC
TGATGCTGTGTTGGGGAATGATGAGCTTCCAGAAGTTCGATGATTCCAGTTGGTAGTTGTCGAGCCATTAGACTCAACCTGATTTTGTGGTCTG
CCGGAATTATTCTTTATCCCGTGAGCATCTTTTCTTGTAGTCACTCTATCTTCTTCACTCTTAATGGTTAATTGCTTATTTTTCTCGATTTTCC
ATGATCTGCTACTAACATTATTTGAAAATTCTGCTCGTTTTTTTGGAGTGCTTGTATTTTTGTGACTAGTGAACTTTGTTTTCGTTTGTTCATC
TTCCTTGTTAGAATGTTCCTCAGCGTCATCAGTTTCATAATCTGGATTCATTTTTGG

Primers for UN02651 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1CCAGTCAATTAAATCATGGGC 59.28721ACTATTGGCACCCGTGAGAC 59.99720141 40180
2CCAGTCAATTAAATCATGGGC 59.28721AGTTTTACGAGAGCGGACGA 60.01520183 40222
3CCAGTCAATTAAATCATGGGC 59.28721TAATGGCGGTGTCGGTTATT 60.20920236 40275