Simple sequence repeat (SSR)
| >UN54035 GTGCAAATTACAAACACATATTAGAAGGCGAGAAACAATACTATACCAAATGCATTTGGATAAAATACAGATAAACATTACTCATAGAAGCGAA CCTTCACTGGCTCAACAATCAAGTTATTCAAGCATATAACCATTCACGTTTCACAGATACACATGACTACAGCATGATGAGGAACATAACACCT CCCCAGCTCCCATGATAAAATATAGCTACTAGACATGGAAATCCCACACGATGCAATATCAGTAAGGGGCCATGGTCCACCTTTGATTACTGTC TTTCTTCCATTCCCACAAACAAATTTTGGTGCCATCACGCACGCCACCATGGTTTTTGTCACCATTCCATGCATCAACATTAAGCTTAATATTG TTGACCATCCTTACTGCCCTATAACCATCCCCTAAGTCCTTGCTCTCGGTCCAAAGAACAGACTCGTCAAGTTTATCAGGGTTGTATTCTGTCA GTTGAACCGGATAAGAAGCACCAACAGAGTGTTTCATGGCTTGACCAGTGGCTTTGTTCACCAACGCAAAAGAAGGATAGCCCTGTTCATCCTT CACTCTTGTGCTAAATTTCAAATCTTTAATCCAATGCTGATGAGGATCAGATGGGTTAGAGGGAGCAAGAACCACTTGACCATCACGGATAGTC ATAGCATAATCAGTTTTCGCCTTACAATAAACCCTCACTGTCGGCTTATCATCCGTATACTTTTTCTCATGTTTCTTCTCATGCTGATCAGTAT GGTGATGGTGATGGTTGATGGTCACCGGTGGCACGTGTGGGACATGGTGGTGACTGGGTTCATGAGAAACATGGTGAATCACTGGTGGTGGTGG TGGGTAGGTGTGATGTGGTGGTGGTGGAGGAGGGTAGTGCTCAACGTGATGTGGTGGTGGTGGTTGGTGGGTATGGTGAGGTGGTGGAGGAGGA GGGTAGTGCTCAACGTGTGGTGGTGGCGGTGGGTAGGTGTGGTGAGGTGGTGGTGGGTACGGTGGTTCGTTATGGTTGTGACGGTATGGGTCCA TTTGGTTCAAAATAACGCGGAATCACAGTTTGCACGGCAACTGACAACTGGTGTGGTTACATAGGTAGGAGGGAGATGTGTTTACTTAACTT |
Primers for UN54035 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | ATGGTGGTGACTGGGTTCAT | 60.096 | 20 | CGTTGAGCACTACCCTCCTC | 59.867 | 20 | 160 | 796 | 955 |
| 2 | AGGGAGCAAGAACCACTTGA | 59.844 | 20 | CGTTGAGCACTACCCTCCTC | 59.867 | 20 | 269 | 624 | 892 |
| 3 | GAGGGAGCAAGAACCACTTG | 59.844 | 20 | CGTTGAGCACTACCCTCCTC | 59.867 | 20 | 270 | 623 | 892 |