Simple sequence repeat (SSR)
| >UN54033 ACTTGACCATCACGGATAGTCATAGCATAATCAGTTTTCGCCTTACAATAAACCCTCACTGTCGGCTTATCATCCGTATACTTTTTCTCATGGT GATCAGTATGGTGATGGTGATGGTTGATGGTCACCGGTGGCACGTGTGGGACATGGTGGTGACTGGGTTCATGAGAAACATGGTGAATCACTGG TGGTGGTGGTGGGTAGGTGTGATGTGGTGGTGGTGGAGGAGGGTAGTGCTCAACGTGATGTGGTGGTGGTGGTTGGTGGGTATGGTGAGGTGGT GGAGGAGGAGGGTAGTGCTCAACGTGTGGTGGTGGCGGTGGGTAGGTGTGGTGAGGTGGTGGTGGGTACGGTGGTTCGTTATGGTTGTGGTGGT TGTGACGGTACGGGTCCATTTGC |
Primers for UN54033 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | ATGGTGGTGACTGGGTTCAT | 60.096 | 20 | CGTTGAGCACTACCCTCCTC | 59.867 | 20 | 160 | 147 | 306 |
| 2 | ATGGTGGTGACTGGGTTCAT | 60.096 | 20 | GAGCACTACCCTCCTCCTCC | 60.216 | 20 | 156 | 147 | 302 |
| 3 | ATGGTGGTGACTGGGTTCAT | 60.096 | 20 | CTCCACCACCTCACCATACC | 60.238 | 20 | 140 | 147 | 286 |