Simple sequence repeat (SSR)
>UN53924 AAAAAAATTAGCTACAAATTAAAACAAAATTACAAATAACTTATGAAAAATAATCAGACAACAAAATTTAACTATGGGTACATGACCAACAAAA CAAAACCAATGAATGATAGAAATGGCAATTTACCCTCGATTAGTTTCATGGTTCATTACTTCTAATAAGTTGTCGATTGTTGTATGGTATGCCT GTTAGGTGTCCTTCAGGACTCGATAGTGAGTTCAGCTATGCCATTACCAATTACCACTGTTTCCGGCAGCGGAAGCAATCATAAAGACATATTC CGGCGGCAGTTAAGTTTACCGTTAATAAAAGCGGCAGCAGCGGCTATTTCCAGTTACCACAGTGTTGACTGTAAAAAAACAAAAAAATATAAAA TATTCGATCAGCACATAATAGTCATATTTTTCCGGTTACCACAGCGGCGGCGGCAGTTTTTGAACCAGCGGAGGCAACTTAGTTTCCGGAGCCG GAGACAGCTTTAATCCAACAACAACATATTTTTCCTGAGGCGGCAGCAGTGTTTCCGGCTGCTTAATACTTGAAAAAAATCCTTTTGGTGGTCG GTCTTGGTGGTGCCGTCCGAAGGTGGTTGGGTCGTTAAATGGTGGTGGGGTTTCCTCGGTCGTGGAGTTGGGTGGTTAAATGGCGGTGGTCGAG GGGTACTGTGGTGGTGGTGGTGTATTTTGTGTTAGTTTGTGTGTGTGTTATAATAGAGTATGTGTGTTTTTGTATTGTGAGATGAGAGTGGGTT TGTCTGTGTTTTATTTT |
Primers for UN53924 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | GTTGGGTCGTTAAATGGTGG | 60.088 | 20 | CAAACCCACTCTCATCTCACAA | 60.149 | 22 | 165 | 590 | 754 |
2 | TGGTTGGGTCGTTAAATGGT | 60.088 | 20 | CAAACCCACTCTCATCTCACAA | 60.149 | 22 | 167 | 588 | 754 |
3 | TTGGGTCGTTAAATGGTGGT | 60.088 | 20 | CAAACCCACTCTCATCTCACAA | 60.149 | 22 | 164 | 591 | 754 |