Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN53352
CTTGGATGGCATTTTTATCTGTATCGATCTTCTCAAGAGCTGGTATGCAAAAGGCTGCTGTCTTTCCAGTTCCATTTTTTTGCTCTAGCAAGAA
TATCACTACCAGTCAAAGCAATAGGAATACTCTCTTCCTGTATAGGGGAAGGCCTTTCAAAACCCTTTTCATATATTCCCATAAGTAGCTCCCT
TTTCAGAAAGTAGTCCTCGAATTCATTTCCTTTCGTGGCTGTGACATCCTCAGTCTTGTACCGGCTATCTGCTGCAGGTATGTTCAACTGTGCT
TTCCAATCTTGAGAGCTTGAATCAACAGTAGTGACAGTTTTCTCAACTTCATTAACATTGGAACTGGAAGAAGAAGAAGAGCCAGTATTAGCAC
TAGTATTAGGGTTCAATCTTAACCACTGTTGTTGTTGTTGCTGTCTTTGTTGGTACTGTTGTTGCTGTGGTTGTCTCTGTTGGTACTGTTGTTG
TTGTTGATATTGTTGATTAGGGTTTCGTGGTTGTTGGTAATTATTAGGGTTTGTTTGGTACTGATAACCACCACCACCACCGCCGCCGCCGCCG
GGATTAGTGTTGTATCCGCCGCGGTTGTTGCCGATGCCGGGAGGGTACCGGCGATTGTTGTTGTTACTGTTGTTGTTGTTCATTGAGAGATGAT
TTTTTGCTGTCAAGTTTTTGTTTGTTTGTTTAGATCGAGAGTTGTGTTTGGGTTGGGTGTAGTGTCGC

Primers for UN53352 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1GCTGTGGTTGTCTCTGTTGG 59.3120GCGGCGGATACAACACTAAT 59.98820147 440586
2GGGTTTCGTGGTTGTTGGTA 60.64720CCCAACCCAAACACAACTCT 59.86120226 490715
3GCTGTGGTTGTCTCTGTTGG 59.3120ATACAACACTAATCCCGGCG 59.84520140 440579