Simple sequence repeat (SSR)
>UN52624 CGGGAGAGATGGTGGTGGTGGTGGTTTGTCGGATGTGGGGTGGTTGGGTGGTAAGAGGTGGTTGTCGTCTTGTGGTTTATGGTGGCGGCTACGG TGGTATAGAAAGGTGGCAACCATTGTGGATATGAAAAGTATGGACAAAAGTGAGAGTGTTAGTGATAAAAACAAGAGTTTCTTGGAGACATGGG ATTTTGAAGGTGGTTGTGGTGATGGAGGAGATGTTGGCCGGAAAAGTAGGTAAGGTGGTGGATGGGACGGTGGTGGTGGTGGTTGATGGGGTGG TGGAGAGTGGGAAGAAGGGGTGGTTATGGTGGTGGTGAGTTTGGGTGGTTGGAGTTATGGATGAGAATGGTTGTTTTGGTAGTGGTGAAGGTGA TGGTGAGGGTGGTTGTGTGGTGGTTTGTGGTGGTAGTGATGGTGGTGGTGGTGGAGGGTCGGTGGCCGGAAAGAAGGGTTGGTGGAGGATCCGG CGAGAGGTGGTGTGGGAAGTGAATAGTGGTAGG |
Primers for UN52624 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | GGCCGGAAAAGTAGGTAAGG | 59.96 | 20 | TCACTTCCCACACCACCTCT | 60.563 | 20 | 269 | 224 | 492 |
2 | TTGGCCGGAAAAGTAGGTAA | 59.581 | 20 | ATCCTCCACCAACCCTTCTT | 59.795 | 20 | 245 | 222 | 466 |
3 | AGATGTTGGCCGGAAAAGTA | 59.569 | 20 | ATCCTCCACCAACCCTTCTT | 59.795 | 20 | 250 | 217 | 466 |