Simple sequence repeat (SSR)
| >UN51675 CTTTGTGCTGATCATAGTTCATCATGCTATCGATAATATATTTAACCCTTCAATTACACTACGAAAAATAGATAAAATTAAGAATCAAGTAATA TTTACATATCATATGCACACGTACTAGCTTGCTCTATCTTCTCTGTTTCCCAAAGTTGTCATGATCTTGGTTTGCAGCCACCATGATTTGAAGT CCACTTGTTTCCGCAATCATAGCAGAACTCATACTTACACCTGCAAGTTATATGCACGCACCCCTCCGCTTTTTCCACAAAAAACTTGCAGTTT GGGCATTTCTTCCACTTGTTCTTCTTAGCAAGTGCAACTGCCAGTTTCTCGTAGTCTTTTTTCCCTTTCTTATTTGTCATGTTAAGTTTCCCAA ACTCCTTGCAGGTAAACTCGGAATGCCAAGGAACGTGACACACTGCACAGATGGACCTGTTGCATACTGGGCAATTGTTTTGCGTAATGGTGCT GTCATCGTTAATTAGTAAAGCTGAGCAATCAGCAAAAGGACAGTAAAACTTGTGGGATTCAAGAATAGTGGACTCGCATAGCACTTGATCCCAT TTGATAAGAATGTGTTTAGGAACGATTAGTCTCAAGGAGTTAAAATCTAGCATGCAATTGCAGTTTAATTCGGGGCACGTAATGGTGCTGGTTT TCTCTAGGATCTTGGTTGTTGCGTGCTTGCGGGTGCAGTCATAACAAAAGGAATGAGAACATGTTGTGTTTGTGAACATTTGCCAGTATTCCTG CTTCTCGAAGCAGATTCTACACATTTGGTGTTGTATGTTGTTGTTGTTGTTCTGTAGCAACGAACTCAGTGAAGAAGGCCTTTCTCTATTATGG GTTCTTGAGGTTGATGTCTGAGAGGCCAATATAGAAGACGACGAAGAAGCTAAGAGGGCTTCTTGGAACTGTAATTCTTGAGCATACTTGGCAT CCGCTTCTTCTAACGTGGTGTCATCTTGAGCGAGAGTCATTGTTTCATTAACGTCGTCACTAGTATCATGATGATGGGTGGTGTTTGGAGATAT CGTCCAACAAGTCTCATCATAGGAGGAGGCCACGGATGTTGTTGTTGTTGGCGTAATAGTATTCTTGGTGGGAATTGAGTAGCAGTAGTAATAG ACAAGAAGAAGAATAACAACAAGAGTGATGATGATGATGAGGATGAACAACAGAAGAAGATGTATTACTGGAGCTAATAATAATAATCCTTGTC TACTTGTTGTTGTAGTATTTGAGATTGATATTGAAATTGATGATATGTTATTTAACTTCAACATCTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTATCTTT ATCTCAACCCATTCACTCAAACTC |
Primers for UN51675 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | GATGTTGTTGTTGTTGGCGT | 59.47 | 20 | GAGTTTGAGTGAATGGGTTGAG | 58.695 | 22 | 272 | 1069 | 1340 |
| 2 | GATGTTGTTGTTGTTGGCGT | 59.47 | 20 | AGTTTGAGTGAATGGGTTGAGA | 58.695 | 22 | 271 | 1069 | 1339 |
| 3 | GATGTTGTTGTTGTTGGCGT | 59.47 | 20 | GTTTGAGTGAATGGGTTGAGA | 57.626 | 21 | 270 | 1069 | 1338 |