Simple sequence repeat (SSR)
>UN51583 CTCAAAACTTGAAAACCATTTGGGTCATCGTGGTTCTGGCGGCGGAAGAACATGATGGACTGTGGATTTCGGTGGTGGCGTCGTTTTCTGTGGT GGTGGTGGTGATGCCGTCGGTATGAGGGCTGCAAGCGGCGGCACTCAATCGGATGGTTGGGGTGGTGTCCGGTTGTCGCAGCTTAGGGTGGTCC GAGGTGGCGTGGAGTGGCGTGGAGGGGCGGTCGCAACCTAGGTTGGTCCTGTGGT |
Primers for UN51583 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | GAAAACCATTTGGGTCATCG | 60.17 | 20 | CAACCATCCGATTGAGTGC | 60.064 | 19 | 143 | 11 | 153 |
2 | GAAAACCATTTGGGTCATCG | 60.17 | 20 | CCAACCATCCGATTGAGTG | 59.902 | 19 | 144 | 11 | 154 |
3 | GATGGACTGTGGATTTCGGT | 59.786 | 20 | CAACCATCCGATTGAGTGC | 60.064 | 19 | 100 | 54 | 153 |