Simple sequence repeat (SSR)
| >UN50845 CACCACCATAACCGCCGCCACCGCCTCCATTCTGGGTACACTCCCTAGCCATATGCCCACTCTCACCACACTTAAAACAACCATTACCACCACC ACCACCTCCTCCACCATACCTATCACCACCACCACGGCTTCCACGTCCACCACCACCATTATAACCACCACCACTTCCACCATACCTATCACCT CCACCATAACGATCACCACCTCCACGGCCACCACCGCCGCCGCCGCCACGTGTACTCCCTTGCACAGGGGCCCCACCAGGACCAGTAACATCAG CAGCCTTAGTCCTACCATCAGATCCTTCCTCAACTACATACTCCACACTTTCACCATCACCAAGGCTTCTAAACCCATCAGACTTGATACTAGA CTGATGGACGAAAAGATCCTCACTGCCGTCTTCTGGTGTGATGAACCCGAACCCTTTGGTGTCGTTGAACCACTTTACGGTTCCGGTTTTACGG CCGCCGTCAACGTCCATTTTTTTTAACCCTAAAAAATTTAACCCTAGTTTTT |
Primers for UN50845 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | AGCCATATGCCCACTCTCAC | 60.104 | 20 | GGAGGTGGTGATCGTTATGG | 60.195 | 20 | 165 | 47 | 211 |
| 2 | AGCCATATGCCCACTCTCAC | 60.104 | 20 | GGTGATCGTTATGGTGGAGG | 60.195 | 20 | 159 | 47 | 205 |
| 3 | CTGGGTACACTCCCTAGCCA | 60.126 | 20 | GGTGATCGTTATGGTGGAGG | 60.195 | 20 | 174 | 32 | 205 |