Simple sequence repeat (SSR)
| >UN50698 CTATTATTTAATTAATCATTAATCATGTACTATATAAAACTAAATAGACAGTAAAAATAAAAATTACCCAAAAAAGAAATAAGTTGCCAATAAT TTACAGATTGCTTTCTACTTTTAGCCATCATGAACAACCAAGATTCTTGGTGCTGGTATGATCCTGAACTCCATTACAAATCCATATATCCTTG ATGGGTTTATGGGATTTCATCACTTTAAGATCTTGTATATTCTTTTTAGTAGATCTGTGAACTTTGACACTTTATTCTTCACTTGAATCTTACA CAAAAACCCTAGAACAAAAAGAGAAAAATGAAGCTAAGTAAGAAAAAGGTGGTGGCTCCGGTGAGTGACGTGGAAGCTGTGGATGGTGCTGGTG GTGGAGGACTGTAGTAGTAGTATGGGAAGTATGGCATAATTGGGTTGGGTGGTTGTGGTGTAGGGTAGTTATTGTTGTTGATGTTGGGGTTTGA TGGTGGTGAAGGTGGTGGGTAGGTGTAGTATGGGCCTTGTGTGTTGGATGGTGGTGGATAGTAGTAGGTGGTGCTACCACCACCACTGCCGGTG TTGGGTGGTGGTGGGCAGATGGTGGTGGTGGGTGGTGATTGTTTGGGAGGTGATGGTGGTGGTGGTGGACAGATGGGAGGTGATGGTGGTGGTG |
Primers for UN50698 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | TTGTTGATGTTGGGGTTTGA | 59.792 | 20 | CACCACCATCACCTCCCAT | 61.668 | 19 | 205 | 451 | 655 |
| 2 | TATGGCATAATTGGGTTGGG | 60.395 | 20 | CACCACCATCACCTCCCAT | 61.668 | 19 | 250 | 406 | 655 |
| 3 | TATGGCATAATTGGGTTGGG | 60.395 | 20 | ACCACCACCATCACCTCC | 59.118 | 18 | 252 | 406 | 657 |