Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN50645
CTTATCAAGCCCTTTACATATCTCCTTGGGAGTCGGAAAACTATTACCCAAATTAGACCCGCCCCAATTCCCATCCCCTGAACCCGAACCAAAC
CCTTCCGTATTCGGTTTACCCGCCCCGGGCAACGGAACAATCTTAACACCATCACCAGCAGGCTGCCAGACCTCAGGTGGGTCACCACCACCAC
CACCAAGACTACCACCAAACATATTAGTACTAGTTTTAAAAAAAGCATAACCCTTATGATGAGGATCTAATTTAGCTAATATGGGTCTGGAACA
AGTGTGCAAATCATGAGTTAGTATTAAGTGCTTAAGTGATGATAAATAAGCTGTGGTTCTTGGTGACTTTGATCTTAAAACAGCAGCAACTGCC
ATTGTCATTAACTTAAATATTTAAGAAAACTTTTGTGGGTATTAAGGTTAAA

Primers for UN50645 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1AACCCTTCCGTATTCGGTTT 59.70420TTGCACACTTGTTCCAGACC 59.72620200 92291
2AAACCCTTCCGTATTCGGTT 59.70420TTGCACACTTGTTCCAGACC 59.72620201 91291
3CATATCTCCTTGGGAGTCGG 59.50220TTGCACACTTGTTCCAGACC 59.72620275 17291