Simple sequence repeat (SSR)
>UN49511 CAAATCACCACCAGGACAAAACTCAGTCAGCAAACACGACCATTTCATCGAGTCTAAGCACGCAAACAGCTTCGGCAAAAAAGGATGATCAAGC ATCTCCAGTATCTCCTTCTCCATCCTTGCTCTCCCTTCTTTATTCCTTATAGCCACTTCCTTTTTATCCATCACCTTTGCAGCAAACAAGCTGC CAGAGGTCACGGCACTGGAAATGGAGGTTGGAAACGAACTGGGGTTTGGTTTAAGTTTGGCTAAGTAAACTGAGCCTATGTCGCCGGAGCCTAG TTTGCGGAGGAAGTGGATGTCTTGTAGAGTTAGGGTTAGGGTTTGTGTGGAAGGTACTGTGTGACTGTGAGTGTCTTTTGTGGTGGTTGAGGAG GAGGTGGAGGTTGTGGTGGTGGTGGTGGTGGAAGAGTGAGGCGGTGGTTGTCGGTG |
Primers for UN49511 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | GAAATGGAGGTTGGAAACGA | 59.91 | 20 | GACAACCACCGCCTCACT | 59.665 | 18 | 223 | 206 | 428 |
2 | CTGGAAATGGAGGTTGGAAA | 59.903 | 20 | GACAACCACCGCCTCACT | 59.665 | 18 | 226 | 203 | 428 |
3 | TGGAAATGGAGGTTGGAAAC | 59.767 | 20 | GACAACCACCGCCTCACT | 59.665 | 18 | 225 | 204 | 428 |