Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN47666
TTAATATTGGAATTTAAAGCTAAAGCTCTTTGTCTCAAAGAAGCTTCTTCTTGGGAGTTTCTTGAAATCAAAGTAGCTGCTGATTCTTGCAGCT
CTTTACTTTGTTCCAAGATTCTTGATACTTCTTCTGCAGTGTTTCTTTCTGATGAGTTACTGTTGTCACCCATTTGAAAGAAATGGGTCGATCT
AGTGGTGGCTTTTGGGTGATGAATGTGGAGGCAATGATGGGTTTTGCGGTGAGTGAACGGTGGTTTATGGTGGTGAATCTAGAGCACACAAAGT
GGTGATGATGATGATGATGAGTGGAAGTGGCTTTTTTTTAGACTTTAGCACTGTGTTCTTAAGTTTT

Primers for UN47666 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1ATGGGTCGATCTAGTGGTGG 59.80320AAGAACACAGTGCTAAAGTCTAAAAA 57.24926166 177342
2GGCTTTTGGGTGATGAATGT 59.79720AAGAACACAGTGCTAAAGTCTAAAAA 57.24926148 195342
3GTGGCTTTTGGGTGATGAAT 59.79720AAGAACACAGTGCTAAAGTCTAAAAA 57.24926150 193342