Simple sequence repeat (SSR)
>UN45062 CAACCGGTACCGAAGACGGTGTAACACCAACCCTGCCTTCCTCACTGCCCCTTAAACCTGAATCTTGAATTGGTGCAGGTGCAGGTGGTGGTGG TTTATAAAATTCAGTGTTTTTGATGGAATTGAAAGCTTGAGTGAAGGATTGAGATGGGTTGAATAAAGATTGTGATGTGGGTTTGGATTGTGAG TTTATTACTTCTTCGTATGATGGGATTTTTATTACAAATGATGATGATGATGAAGAAGGGTTGTTTGTGTTTGGGGTTTGGTTATTGTTTGGGT TCATGTTTTGGT |
Primers for UN45062 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | CACTGCCCCTTAAACCTGAA | 60.103 | 20 | AACCAAACCCCAAACACAAA | 60.103 | 20 | 229 | 43 | 271 |
2 | GTGTAACACCAACCCTGCCT | 59.891 | 20 | AACCAAACCCCAAACACAAA | 60.103 | 20 | 253 | 19 | 271 |
3 | CTCACTGCCCCTTAAACCTG | 59.728 | 20 | AACCAAACCCCAAACACAAA | 60.103 | 20 | 231 | 41 | 271 |