Simple sequence repeat (SSR)
>UN44993 CATACGGCTAAAAAGGGCTTGTAGGAAATAAGATGATAGCTTTTGATCTGTGTCACCATATGGTGAGCTTAGCTCATTAAGCATCCACATGAGT TGTTGCAACCTAGAACTGTTTTTATCCGCAACGGCACGTGCTGCATCTAGCAGCACGTCCGAAGCCCATGTGTTAGTGGTGAATGAGTTTGAGT ATTCCATTGTGACATCTCTAGCTGGTGAGTATGAGTAGTTGATGTTCGGATCGGATGATTGTTGGTGTTCAGAAGTCGAAAAGCCATAGTGAGA TAAGGGTGGTGGAGTGGTTGTTGCGCTAGTTGTTGGAGTAGGTGTGTTGGATAATGATTGGTGGCTATAGGGTGGTTGTTGAGATGAGTAGTAT TGGTTTTGGTTTTGGTGGTGCCTTGAGGAAGAAGAATAGTCTTCTTCATCCATGAAAAAGTTGAAGCATTCTTCTTGTTCTTGTGGTTGTTGGT AGTTGAAATGATATGGCGTTTGTTGAGTGGATGATCTTGAACTGCTTGAGTTAGTTGTTGTAGTGGTGGTTGAGTTGTTAAAAGAATGAGGATG TGGATGATGAGGATGGTGTTGCTTTTGGAAGGTTACAAGCCTAAAGAGAGTATCCATTACAACTAGACATAACAAAGATTCATCACATGTATAA ATGGCATGCAAGTGTGTGTGTGTTTGTGTTGTGTTTTTGTGTTAGTTTTTAACGGGACTTGGAAGAATTTGGATATGGAGAGG |
Primers for UN44993 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | ATGGTGTTGCTTTTGGAAGG | 59.971 | 20 | CAAATTCTTCCAAGTCCCGT | 59.028 | 20 | 153 | 577 | 729 |
2 | ATGGTGTTGCTTTTGGAAGG | 59.971 | 20 | TCCAAATTCTTCCAAGTCCC | 58.956 | 20 | 155 | 577 | 731 |
3 | TATGGCGTTTGTTGAGTGGA | 60.111 | 20 | CAAATTCTTCCAAGTCCCGT | 59.028 | 20 | 248 | 482 | 729 |