Simple sequence repeat (SSR)
>UN01767 GTTTCTCTATAACTGTGGCTCTGATACCAATCTGTAACACCCCCAAAAATGGTTTGCAGCGGAAGAAAAAGTTTTTGGGATGCTACTCAGTTGG ATCATAACACAAGTGAAAAATAATAGCTTTTTCGTAAAATATTTCATTTATTGTAGTAAAACAAAGTTTACAAAAGTTGAATTGTTGCGGAAAA ATGGCTTATTAACAAAATGTTGTCCCCATTCGTAAATCAGAGTCATCTATGACCATGCCATGCCAATGCCCAAGCGCCTCCAGAGTTAGCTATC GCCTTTTCATCCTTGGTTTGCAGAAATGTAAGACATCACAATTAACATCAAGTAATAAACGTGCACGGCTCCGACACGCAACCTAATTAATACG GCAATTTAGTCTTTATGTTTAAGACTCGATAAAGTTTAACTAACTTTATAAATTTTTAAATGTTTGTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTTGTGTG GCATTGACTTATCTTAGAACAATTTGTAAGG |
Primers for UN01767 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | TATCGCCTTTTCATCCTTGG | 60.031 | 20 | TTCTAAGATAAGTCAATGCCACACA | 60.069 | 25 | 211 | 279 | 489 |
2 | TATCGCCTTTTCATCCTTGG | 60.031 | 20 | TGTTCTAAGATAAGTCAATGCCACA | 60.069 | 25 | 213 | 279 | 491 |
3 | TATCGCCTTTTCATCCTTGG | 60.031 | 20 | TCTAAGATAAGTCAATGCCACACA | 58.834 | 24 | 210 | 279 | 488 |