Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN42348
GTCTTCTCAACTTCTGGCTCCTCTTGTACAATCCTTGGCTTCTTTTCATCCTCCACACGATTGCAACTAGAGCACCGATGACCGTCATGGCTCT
TTTTATCAAAGTCATACCTAGGCTGCTCAACCGAATAATGTGGTGGTGGAATATGGTAACCAGGATAGGCACCAGGAAACGGAGGATAAAACCC
GTGAGAGTAGAATGATGGTGATGGTGGTGGTGGTGGGTAGTGAGGGTATGGAGGTCGGTAACTGTACTGACCACCACCGTAATAGCCATGGTTG
CAACAACCATGATACTCATGTGGGACAGGATAAGGGTTATTGGCACTATAAGGCCATGGTTGTTGATATGGCAGAATCATGGTACTAGGATCCA
TTTTCATATGAGGTGTGATCTCTTTGGCTCTTGGATCATCGTTTGGAGCATAAGGCATTGGAGCAGTGTGATGGGGGAATGAGTACGGGTATGC

Primers for UN42348 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1CACCAGGAAACGGAGGATAA 59.92620AATGCCTTATGCTCCAAACG 60.09620272 164435
2TAACCAGGATAGGCACCAGG 59.94820GCAACCATGGCTATTACGGT 59.85120133 151283
3CACCAGGAAACGGAGGATAA 59.92620GCAACCATGGCTATTACGGT 59.85120120 164283