Simple sequence repeat (SSR)
>UN41959 ATGGTCTTCTGGCAGCGCAACTATTCACGGCAACATTACAGCTACTTCCTTTAACCCCAAATGTTACAGATCTATAGATGGTGGTTAGATGTCT CGGTTTAAAATCATCTGATGACGTTACAATATCAGATCGACTTGTACATTGATGGTGGTTAGCGACAGCGTTTTGCGATGGTGGTCAACGGTTG TGTGACGTTTGTATAAGGTGGTGGTGGTGGTGATAGTGATGATGAAGATGACGATGACGGGATTTATGGAGTTATGCGATGGTGATGGAGGTGG AATGGTGGTT |
Primers for UN41959 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | TTGATGGTGGTTAGCGACAG | 59.716 | 20 | ATCCCGTCATCGTCATCTTC | 59.893 | 20 | 109 | 143 | 251 |
2 | GTGGTTAGCGACAGCGTTTT | 60.313 | 20 | ATCCCGTCATCGTCATCTTC | 59.893 | 20 | 103 | 149 | 251 |
3 | TTGATGGTGGTTAGCGACAG | 59.716 | 20 | TCCATAAATCCCGTCATCGT | 60.155 | 20 | 116 | 143 | 258 |