Simple sequence repeat (SSR)
>UN38749 CGTTCAACTCTTTGTTCTCTAACGAACGCTCGTCACTTCAAGGTACCTCTTTACAAACTTCTAAGGCCTCCTTACATGATTTCACATAACTGAC ATAAACCTTACAACCAGCTTTGCCAAAAGCTAGTGCAATTGCCTTGCCGACACCCCTAAAATCTCCTTTGGAGCCAAAGTAGCATACCAGTCAT CTTGTTTTTGAGCTTTGGTTGTGGTTGACCCATTATATATAGAGAAAGGTCTTGCAGCGGTAGTTAAGATCCTGCACTTTAGCAATGTTAGAAA TAGTTCTCTCCCCATCTTTAACTTTGCCTCAATATAAGCTCCCCATCTTTAACTTTGTCTTGCTCCTAATTGAATTAGTATGTTACTGGCTTAG TTGCGTGACTAAGGTGGCCAGTGACGGGAATGATGTGCGACGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGTGACGGTGGTTAAGTTGTGGTGG |
Primers for UN38749 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | AGAAAGGTCTTGCAGCGGTA | 60.015 | 20 | CCACCACAACTTAACCACCG | 61.231 | 20 | 231 | 231 | 461 |
2 | GAAAGGTCTTGCAGCGGTAG | 60.015 | 20 | CACCACAACTTAACCACCGTC | 60.319 | 21 | 229 | 232 | 460 |
3 | AGAAAGGTCTTGCAGCGGTA | 60.015 | 20 | CACCACAACTTAACCACCGTC | 60.319 | 21 | 230 | 231 | 460 |