Simple sequence repeat (SSR)
>UN36403 ATAACAACATCATCAATTGAGGTCACATATCGAATTTGATAACAGATCGGAGTGGATAACAAATCGGATTTTCTTTCCGGCGTGGTCCGCCAGT AAAGTTCTCCGATCTGAAGGATTTGATGTGAGTTGAGATAGATGAACACGATGGTTGTGTTGTGGTGGTGGTCGAGCAATGGATCTGGTGGAAG GTGGTGGCTGAGAGAGAAAGAGTAGTGGTTATGAGTATGTTTGGGTCCGACTCTTATGTTGTGGTGGTGGTCGTGCAACAGATCTGGTGGTGGT GGTGGAACGTGGTGGGTAGCCGGATCTGCTGGTGGTGGCTGGCTGGCCGAATCTGATGG |
Primers for UN36403 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | AAGGTGGTGGCTGAGAGAGA | 59.986 | 20 | CACCAGCAGATCCGGCTAC | 61.789 | 19 | 131 | 186 | 316 |
2 | AGGTGGTGGCTGAGAGAGAA | 59.986 | 20 | CACCAGCAGATCCGGCTAC | 61.789 | 19 | 130 | 187 | 316 |
3 | GAAGGTGGTGGCTGAGAGAG | 59.986 | 20 | CACCAGCAGATCCGGCTAC | 61.789 | 19 | 132 | 185 | 316 |